More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2275 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.31 
 
 		 544 aa  900    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.88 
 
 		 544 aa  892    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.76 
 
 		 544 aa  903    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 544 aa  1118    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.7 
 
 		 552 aa  938    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.83 
 
 		 548 aa  839    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.55 
 
 		 544 aa  908    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  49.64 
 
 		 547 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.36 
 
 		 547 aa  504  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.44 
 
 		 541 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.74 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  32.05 
 
 		 510 aa  186  7e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  32.74 
 
 		 497 aa  186  9e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  30.51 
 
 		 510 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.51 
 
 		 510 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  30.7 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  30.75 
 
 		 503 aa  182  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.53 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.75 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32.49 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.65 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  30.1 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  32.05 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.02 
 
 		 530 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.83 
 
 		 507 aa  169  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  32.24 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.14 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  30.48 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.9 
 
 		 501 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  29.67 
 
 		 500 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.48 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  30.38 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.48 
 
 		 500 aa  163  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.8 
 
 		 507 aa  161  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  31.46 
 
 		 510 aa  160  8e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.67 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.67 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.11 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  35.86 
 
 		 741 aa  133  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.87 
 
 		 1527 aa  121  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.65 
 
 		 1519 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.07 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.94 
 
 		 1577 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.07 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  29.94 
 
 		 1572 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.3 
 
 		 1572 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.07 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.22 
 
 		 1518 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.73 
 
 		 1512 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  29.93 
 
 		 543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.79 
 
 		 1518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.79 
 
 		 1518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.4 
 
 		 529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  27.86 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.79 
 
 		 1518 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  31.13 
 
 		 1508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  31.58 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.55 
 
 		 1482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  29.49 
 
 		 1542 aa  115  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.59 
 
 		 1469 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.46 
 
 		 1525 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.04 
 
 		 1482 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  32.82 
 
 		 747 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.83 
 
 		 712 aa  114  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.79 
 
 		 540 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  28.46 
 
 		 1571 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.12 
 
 		 516 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.55 
 
 		 1513 aa  113  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.02 
 
 		 1475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.21 
 
 		 1551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.44 
 
 		 1486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.83 
 
 		 1501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.55 
 
 		 1527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  29.02 
 
 		 1475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  31.25 
 
 		 1482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  30.53 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.81 
 
 		 1519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.74 
 
 		 1482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  29.89 
 
 		 1697 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3407  Glutamate synthase (NADPH)  30.09 
 
 		 533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6830  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.36 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.19 
 
 		 1537 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.12 
 
 		 1498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0466  glutamate synthase (ferredoxin)  29.1 
 
 		 1546 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.6 
 
 		 1510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.07 
 
 		 1554 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3730  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.07 
 
 		 1554 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  31.32 
 
 		 1535 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  31.4 
 
 		 1518 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  31.47 
 
 		 1486 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16921  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.57 
 
 		 1524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16351  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.35 
 
 		 1531 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.82 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.52 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  31.32 
 
 		 1485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  30.5 
 
 		 1514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.82 
 
 		 516 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  31.32 
 
 		 1485 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.74 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>