More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1724 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.7 
 
 		 544 aa  915    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.25 
 
 		 548 aa  856    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.09 
 
 		 544 aa  891    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.7 
 
 		 544 aa  902    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 552 aa  1135    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.49 
 
 		 544 aa  904    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.26 
 
 		 544 aa  904    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  49.73 
 
 		 547 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.46 
 
 		 547 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.99 
 
 		 541 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.36 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.96 
 
 		 502 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.33 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  28.93 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  30.77 
 
 		 497 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.19 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  33.33 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.61 
 
 		 502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.2 
 
 		 507 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  29.1 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.91 
 
 		 510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  29.41 
 
 		 530 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.21 
 
 		 509 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  28.91 
 
 		 510 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  32.23 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  30.7 
 
 		 509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.47 
 
 		 505 aa  162  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.13 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.67 
 
 		 507 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  32.1 
 
 		 501 aa  157  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  31.28 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  31.28 
 
 		 507 aa  154  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  30.62 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.71 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.18 
 
 		 500 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  30.02 
 
 		 500 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.45 
 
 		 501 aa  144  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  28.33 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  33.63 
 
 		 741 aa  126  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  31.9 
 
 		 1572 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.9 
 
 		 1572 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.57 
 
 		 1518 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.86 
 
 		 1498 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.14 
 
 		 1577 aa  123  9e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.94 
 
 		 1482 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.07 
 
 		 1527 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.19 
 
 		 1512 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.79 
 
 		 1571 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.12 
 
 		 1482 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.13 
 
 		 1511 aa  120  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.93 
 
 		 1519 aa  120  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  32.59 
 
 		 747 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.95 
 
 		 1525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.58 
 
 		 1537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.94 
 
 		 1513 aa  119  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  31.68 
 
 		 1542 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.87 
 
 		 1510 aa  118  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.47 
 
 		 1518 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  32.04 
 
 		 1508 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.88 
 
 		 1482 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.47 
 
 		 1518 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.47 
 
 		 1518 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.57 
 
 		 534 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.4 
 
 		 1550 aa  117  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.39 
 
 		 1516 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.83 
 
 		 1520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.28 
 
 		 1519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  32.3 
 
 		 543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.98 
 
 		 1468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.83 
 
 		 712 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_51214  ferredoxin-dependent glutamate synthase, fusion of large and small subunits  28.3 
 
 		 1591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.92 
 
 		 1530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  29.48 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.19 
 
 		 1486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.14 
 
 		 1482 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.02 
 
 		 1513 aa  115  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  31.36 
 
 		 1510 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.93 
 
 		 1516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.83 
 
 		 1524 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.12 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  30.29 
 
 		 1514 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  32.34 
 
 		 1482 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.55 
 
 		 1509 aa  114  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0107  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.81 
 
 		 1535 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.11 
 
 		 1502 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.85 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  31.27 
 
 		 1697 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.5 
 
 		 529 aa  113  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.17 
 
 		 1575 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1114  glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 		 1533 aa  113  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82784  normal  0.930552 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  31.44 
 
 		 1533 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.17 
 
 		 1509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  31.35 
 
 		 1512 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.49 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.69 
 
 		 533 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  30.29 
 
 		 1518 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  30.5 
 
 		 1535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>