More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1156 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 541 aa  1112    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  66.79 
 
 		 547 aa  745    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.34 
 
 		 547 aa  749    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.36 
 
 		 544 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.26 
 
 		 544 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.99 
 
 		 552 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.99 
 
 		 544 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.36 
 
 		 548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.44 
 
 		 544 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  47.71 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.64 
 
 		 497 aa  206  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  29.45 
 
 		 503 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.62 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31.15 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  29.74 
 
 		 509 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.58 
 
 		 510 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.12 
 
 		 507 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.12 
 
 		 507 aa  183  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.07 
 
 		 502 aa  179  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.51 
 
 		 503 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  30.31 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.56 
 
 		 502 aa  178  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  28.65 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  29.31 
 
 		 500 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  29.31 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.31 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  28.98 
 
 		 510 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  29.17 
 
 		 510 aa  172  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.28 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.81 
 
 		 501 aa  170  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.98 
 
 		 510 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.46 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  28.49 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  29.78 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  29.63 
 
 		 507 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  29.25 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.66 
 
 		 505 aa  159  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  29.94 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  29.98 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.32 
 
 		 1519 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.37 
 
 		 516 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1346  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.38 
 
 		 1520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.41 
 
 		 1519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  31 
 
 		 1518 aa  131  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.85 
 
 		 1572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32.85 
 
 		 1572 aa  130  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.65 
 
 		 1577 aa  130  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.09 
 
 		 1479 aa  130  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1903  glutamate synthase domain-containing protein  31.93 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1518  Glutamate synthase (NADPH)  29.65 
 
 		 518 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.532472  hitchhiker  0.00131604 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.95 
 
 		 516 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.19 
 
 		 1479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  32.56 
 
 		 1518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.51 
 
 		 529 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 		 693 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.64 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1794  glutamate synthase (ferredoxin)  31.56 
 
 		 1526 aa  127  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.856198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1535 aa  127  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  32.25 
 
 		 1486 aa  127  7e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1485 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  32.09 
 
 		 1485 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  34.2 
 
 		 1486 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.24 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  29.92 
 
 		 1498 aa  126  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  32.65 
 
 		 1571 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  32.79 
 
 		 1482 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  32.25 
 
 		 1514 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  32.29 
 
 		 1510 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.87 
 
 		 1468 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.25 
 
 		 1518 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  31.9 
 
 		 741 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.25 
 
 		 1518 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.25 
 
 		 1518 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 		 1497 aa  124  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1136  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1482 aa  124  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.36 
 
 		 1536 aa  124  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0092  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.14 
 
 		 496 aa  124  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.554506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1486 aa  124  6e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1482 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  32.58 
 
 		 1482 aa  123  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.79 
 
 		 1482 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  32.51 
 
 		 1482 aa  123  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.69 
 
 		 1482 aa  123  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  30.55 
 
 		 685 aa  123  9e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  33.43 
 
 		 681 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  31.92 
 
 		 1513 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0817  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.2 
 
 		 1535 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  32.2 
 
 		 1462 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  31.67 
 
 		 1488 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1482 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1482 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1482 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  32.29 
 
 		 1510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  32.15 
 
 		 1542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1255  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.600674 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  31.18 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3135  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.429634  normal  0.864328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1178  glutamate synthase subunit alpha  32.49 
 
 		 1482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0869  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.9 
 
 		 1536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.600507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0489  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.61 
 
 		 502 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>