More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0103 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.78 
 
 
544 aa  886    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.4 
 
 
544 aa  1001    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.55 
 
 
544 aa  884    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.49 
 
 
552 aa  904    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.49 
 
 
544 aa  918    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.82 
 
 
548 aa  825    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 
544 aa  1118    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  49.54 
 
 
547 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.82 
 
 
547 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.26 
 
 
541 aa  485  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  30.8 
 
 
503 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  32.44 
 
 
497 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.87 
 
 
502 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.13 
 
 
503 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.54 
 
 
503 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  31.62 
 
 
509 aa  176  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.29 
 
 
510 aa  174  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  33.18 
 
 
502 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.37 
 
 
530 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.65 
 
 
502 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  31.24 
 
 
509 aa  167  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  29.89 
 
 
510 aa  166  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.15 
 
 
510 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.41 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.71 
 
 
507 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  30.34 
 
 
510 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.29 
 
 
509 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  29.9 
 
 
507 aa  160  5e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  29.9 
 
 
507 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  29.81 
 
 
502 aa  160  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  32 
 
 
501 aa  159  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  32.06 
 
 
500 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.46 
 
 
505 aa  159  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.24 
 
 
507 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  30.46 
 
 
500 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  30.24 
 
 
500 aa  151  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.16 
 
 
500 aa  150  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.2 
 
 
501 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  29.66 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.02 
 
 
1474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  34.69 
 
 
741 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32.25 
 
 
1572 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.54 
 
 
1486 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.33 
 
 
1577 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.25 
 
 
1572 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.33 
 
 
1510 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.35 
 
 
1571 aa  124  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  31.73 
 
 
1487 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  32.11 
 
 
1498 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.66 
 
 
1527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.54 
 
 
1518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  31.44 
 
 
1487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  32.29 
 
 
543 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.13 
 
 
1519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.71 
 
 
1468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.06 
 
 
712 aa  120  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.62 
 
 
1508 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  31.67 
 
 
1542 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  31.88 
 
 
1507 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  29.9 
 
 
1567 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1516  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.38 
 
 
540 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.852004  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  32.68 
 
 
685 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.53 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.53 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.53 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.23 
 
 
1512 aa  118  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.14 
 
 
1537 aa  118  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.03 
 
 
747 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0566  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.43 
 
 
543 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.212198  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.4 
 
 
1486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.37 
 
 
693 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0474  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.93 
 
 
543 aa  117  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  31.52 
 
 
1483 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  29.26 
 
 
1512 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.26 
 
 
1512 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.68 
 
 
1479 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.79 
 
 
1513 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  28.57 
 
 
1519 aa  116  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.3 
 
 
1516 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2913  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.86 
 
 
529 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.57199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  32.02 
 
 
529 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.12 
 
 
1518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.12 
 
 
1518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.12 
 
 
1518 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.1 
 
 
1511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.53 
 
 
1520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  30.42 
 
 
1513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.52 
 
 
1509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.18 
 
 
1518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.65 
 
 
1510 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.92 
 
 
1575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0262  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.34 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  30.75 
 
 
1486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0064  glutamate synthase subunit alpha  31.17 
 
 
1484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.23 
 
 
1530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  30.75 
 
 
1486 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  30.83 
 
 
1482 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.11 
 
 
1584 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.18 
 
 
534 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>