More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1371 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  77.76 
 
 		 544 aa  882    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.43 
 
 		 544 aa  902    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 544 aa  1127    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75 
 
 		 548 aa  813    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.86 
 
 		 544 aa  918    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.09 
 
 		 552 aa  891    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.49 
 
 		 544 aa  918    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  49.45 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.73 
 
 		 547 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  46.99 
 
 		 541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  31.37 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.47 
 
 		 502 aa  193  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  31.98 
 
 		 497 aa  190  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.49 
 
 		 503 aa  189  9e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.19 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  31.48 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.19 
 
 		 509 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.8 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  30.71 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.33 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  33.41 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  29.81 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.62 
 
 		 510 aa  170  7e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  29.57 
 
 		 507 aa  170  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  29.57 
 
 		 507 aa  170  8e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  29.81 
 
 		 510 aa  169  9e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  32.6 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.66 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.71 
 
 		 505 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.04 
 
 		 509 aa  166  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.06 
 
 		 507 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.47 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  28.77 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  28.97 
 
 		 500 aa  163  1e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  29.4 
 
 		 502 aa  161  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.92 
 
 		 507 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.84 
 
 		 500 aa  160  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.69 
 
 		 501 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  29.65 
 
 		 510 aa  143  8e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.23 
 
 		 1577 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  35.28 
 
 		 741 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.88 
 
 		 1571 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.74 
 
 		 747 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  30.7 
 
 		 1572 aa  128  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.7 
 
 		 1572 aa  128  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.77 
 
 		 1519 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.13 
 
 		 712 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.95 
 
 		 1520 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  30.9 
 
 		 1508 aa  124  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.07 
 
 		 1527 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.56 
 
 		 1525 aa  122  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  31.73 
 
 		 1486 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.08 
 
 		 1512 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  33.23 
 
 		 543 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.14 
 
 		 1498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.29 
 
 		 1518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  31.28 
 
 		 685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.44 
 
 		 1474 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1935  glutamate synthase (ferredoxin)  29.53 
 
 		 1548 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891386  normal  0.412086 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.51 
 
 		 531 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.31 
 
 		 1537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.92 
 
 		 1550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.69 
 
 		 1519 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.81 
 
 		 1518 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.93 
 
 		 1513 aa  120  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.81 
 
 		 1518 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.81 
 
 		 1518 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.32 
 
 		 1550 aa  120  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  32.24 
 
 		 1563 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.84 
 
 		 1510 aa  120  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1988  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.2 
 
 		 1497 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.65 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.67 
 
 		 1516 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.65 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  28.91 
 
 		 1567 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.53 
 
 		 516 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.73 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.65 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1617  glutamate synthase (ferredoxin)  29.07 
 
 		 1553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  31.51 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  30.32 
 
 		 1697 aa  119  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.68 
 
 		 1533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000267  glutamate synthase [NADPH] large chain  30.11 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.18 
 
 		 1469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.99 
 
 		 1516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  30.06 
 
 		 1542 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.17 
 
 		 1510 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  29.66 
 
 		 1512 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  29.66 
 
 		 1512 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  31.36 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.08 
 
 		 1468 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.57 
 
 		 1575 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.02 
 
 		 1530 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  29.89 
 
 		 1482 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  27.51 
 
 		 1521 aa  117  5e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  31.61 
 
 		 1482 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.24 
 
 		 533 aa  117  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.64 
 
 		 1524 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.17 
 
 		 1513 aa  117  5e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.23 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>