More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0384 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75.09 
 
 		 544 aa  857    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75 
 
 		 544 aa  863    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  79.2 
 
 		 544 aa  867    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.83 
 
 		 544 aa  871    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  80.25 
 
 		 552 aa  915    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 548 aa  1120    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  76.82 
 
 		 544 aa  875    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  50.45 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.09 
 
 		 547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.45 
 
 		 541 aa  498  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  31.13 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.19 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.07 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.15 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  29.9 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  31.86 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  30.97 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  33.26 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.77 
 
 		 530 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  32.88 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.11 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.29 
 
 		 510 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  30.29 
 
 		 510 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  30.48 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  32.6 
 
 		 509 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.68 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.89 
 
 		 507 aa  163  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  32.36 
 
 		 500 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.75 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.85 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  31.17 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.32 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  30.97 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  30.97 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.55 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  29.06 
 
 		 502 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  31.1 
 
 		 500 aa  160  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  30.98 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.46 
 
 		 501 aa  143  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.65 
 
 		 1527 aa  124  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.68 
 
 		 1518 aa  123  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.96 
 
 		 1572 aa  123  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32.96 
 
 		 1572 aa  123  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  34.21 
 
 		 741 aa  123  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.05 
 
 		 1512 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  32.22 
 
 		 1571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.21 
 
 		 1577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.31 
 
 		 1519 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  33.84 
 
 		 747 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  30.36 
 
 		 1498 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.24 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.24 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.61 
 
 		 1468 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.24 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  33.54 
 
 		 1482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 		 1511 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0330  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.47 
 
 		 1513 aa  118  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.954616 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  31.55 
 
 		 1508 aa  118  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1666  glutamate synthase (ferredoxin)  33.51 
 
 		 1512 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0329464  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  32.14 
 
 		 1482 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1078  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.9 
 
 		 1513 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.706498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2807  glutamate synthase (ferredoxin)  30.93 
 
 		 1512 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1146  glutamate synthase (NADPH) large subunit  30.93 
 
 		 1512 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  32.4 
 
 		 1482 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  31.02 
 
 		 1542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3022  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.81 
 
 		 1519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  33.14 
 
 		 1486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.05 
 
 		 1575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  33.74 
 
 		 1482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5008  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.45 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0610  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.01 
 
 		 1510 aa  114  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.62 
 
 		 1525 aa  114  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.66 
 
 		 1518 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.66 
 
 		 1518 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  31.02 
 
 		 1697 aa  114  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.66 
 
 		 1518 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  32.63 
 
 		 1482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0988  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.11 
 
 		 533 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1173  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.47 
 
 		 1520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2217  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.27 
 
 		 1516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  29.61 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0657  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.03 
 
 		 1509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1935  glutamate synthase (ferredoxin)  31.17 
 
 		 1548 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891386  normal  0.412086 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2781  glutamate synthase (ferredoxin)  30.39 
 
 		 1512 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975525  normal  0.828421 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11000  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.9 
 
 		 1550 aa  114  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.542266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3013  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.91 
 
 		 1518 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0945186 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2866  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.18 
 
 		 1519 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.166773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2949  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.7 
 
 		 1501 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.51 
 
 		 1537 aa  113  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5847  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.22 
 
 		 534 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3166  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.75 
 
 		 1516 aa  113  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.563815  normal  0.707717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10003  glutamate synthase  28.77 
 
 		 538 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0761  glutamate synthase ferredoxin subunit  29.56 
 
 		 1573 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220538  normal  0.186889 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.15 
 
 		 1574 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.5 
 
 		 712 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  31.19 
 
 		 1564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  32.42 
 
 		 1482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5702  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.88 
 
 		 1550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  31.86 
 
 		 1482 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0615  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>