More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2599 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  100 
 
 		 547 aa  1133    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  66.79 
 
 		 541 aa  745    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.65 
 
 		 547 aa  1002    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50 
 
 		 544 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.54 
 
 		 544 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.73 
 
 		 552 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.45 
 
 		 544 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.09 
 
 		 544 aa  501  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.64 
 
 		 544 aa  500  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  50.09 
 
 		 548 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.06 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  30.77 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.43 
 
 		 502 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.23 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  30.77 
 
 		 503 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.52 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.21 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.36 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  31.4 
 
 		 510 aa  188  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.54 
 
 		 507 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.78 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  28.88 
 
 		 507 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.77 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  28.82 
 
 		 507 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  28.98 
 
 		 505 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  29.02 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  30.23 
 
 		 497 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  30.32 
 
 		 502 aa  171  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  28.95 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  27.94 
 
 		 500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  27.94 
 
 		 500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  28.38 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  28.38 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.17 
 
 		 500 aa  162  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.68 
 
 		 509 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  28.45 
 
 		 500 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.55 
 
 		 501 aa  156  9e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  30.75 
 
 		 501 aa  153  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.03 
 
 		 1577 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  34.15 
 
 		 1518 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  35.45 
 
 		 1572 aa  147  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.45 
 
 		 1572 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  32.83 
 
 		 1571 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  30.44 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 		 1498 aa  143  9e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  34.83 
 
 		 1563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  34.75 
 
 		 1564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  33.8 
 
 		 1510 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  33.81 
 
 		 1507 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  33.52 
 
 		 1510 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  33.89 
 
 		 1507 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.83 
 
 		 1519 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  33.14 
 
 		 1513 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.9 
 
 		 1510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.71 
 
 		 516 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  31.62 
 
 		 1477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  33.73 
 
 		 516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.48 
 
 		 1505 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  35.04 
 
 		 1524 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  32.11 
 
 		 1478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2562  glutamate synthase, large subunit  29.52 
 
 		 1515 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.89 
 
 		 1479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  32.46 
 
 		 1518 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 		 1468 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.53 
 
 		 516 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  32.76 
 
 		 741 aa  127  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  31.83 
 
 		 1478 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.23 
 
 		 1519 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.23 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.82 
 
 		 1579 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.456903 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  34.1 
 
 		 1574 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  31.83 
 
 		 1478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.49 
 
 		 1475 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.13 
 
 		 1551 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.22 
 
 		 1518 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3593  glutamate synthase (ferredoxin)  32.05 
 
 		 1514 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.544233  normal  0.0352812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3734  glutamate synthase large subunit  33.24 
 
 		 1573 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.22 
 
 		 1518 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.22 
 
 		 1518 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  33.24 
 
 		 1542 aa  124  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.49 
 
 		 1529 aa  124  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 		 1483 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.93 
 
 		 1479 aa  124  7e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.22 
 
 		 1516 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  33.72 
 
 		 1527 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1511 aa  123  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  33.43 
 
 		 1574 aa  123  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4531  glutamate synthase ferredoxin subunit  31.92 
 
 		 1579 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.688027  normal  0.696569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0341  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.54 
 
 		 1489 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.36 
 
 		 1499 aa  123  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.78 
 
 		 693 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  31.55 
 
 		 1478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.46 
 
 		 1536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  31.55 
 
 		 1478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2957  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.79 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  32.26 
 
 		 1473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  31.55 
 
 		 1478 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.84 
 
 		 1575 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.59 
 
 		 1584 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3718  glutamate synthase, large subunit  30.15 
 
 		 1648 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>