More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2160 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  67.34 
 
 		 541 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  86.65 
 
 		 547 aa  1002    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 547 aa  1131    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.82 
 
 		 544 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.82 
 
 		 544 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.46 
 
 		 552 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.73 
 
 		 544 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.63 
 
 		 544 aa  496  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.55 
 
 		 548 aa  495  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  48.36 
 
 		 544 aa  489  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  32.14 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  30.29 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  32 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  29.21 
 
 		 503 aa  191  2e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  30.19 
 
 		 507 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  30.87 
 
 		 502 aa  190  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  31.05 
 
 		 510 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.39 
 
 		 507 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.7 
 
 		 502 aa  189  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.19 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  30.06 
 
 		 507 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  30.68 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.5 
 
 		 510 aa  181  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  28.92 
 
 		 497 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  29.67 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  28.98 
 
 		 505 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  28.95 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  28.68 
 
 		 500 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  28.49 
 
 		 500 aa  173  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  28.49 
 
 		 509 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  27.92 
 
 		 500 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  28.88 
 
 		 500 aa  169  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.61 
 
 		 501 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  28.46 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  28.46 
 
 		 507 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  30.34 
 
 		 509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  29.13 
 
 		 501 aa  163  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.57 
 
 		 509 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.06 
 
 		 1518 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  29.06 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  32.24 
 
 		 1498 aa  146  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32.96 
 
 		 1572 aa  144  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.96 
 
 		 1572 aa  144  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.05 
 
 		 1577 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  32.82 
 
 		 1571 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.89 
 
 		 1519 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3450  glutamate synthase-related protein  33.81 
 
 		 1510 aa  136  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0147  glutamate synthase (ferredoxin)  32.29 
 
 		 1510 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0452  glutamate synthase (ferredoxin)  31.92 
 
 		 1477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  34.04 
 
 		 516 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0393  glutamate synthase (ferredoxin)  33.24 
 
 		 1507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0484  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.52 
 
 		 1505 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  33.05 
 
 		 1564 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0729  glutamate synthase (ferredoxin)  33.52 
 
 		 1507 aa  133  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.89 
 
 		 1468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2944  glutamate synthase, large subunit  32.77 
 
 		 1513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  33.15 
 
 		 1563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.85 
 
 		 1510 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0530  glutamate synthase subunit alpha  33.24 
 
 		 1485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1128  glutamate synthase subunit alpha  33.24 
 
 		 1535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0466  glutamate synthase subunit alpha  33.24 
 
 		 1485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.820942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  34.04 
 
 		 1486 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  31.68 
 
 		 1482 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0446  glutamate synthase (ferredoxin)  32.39 
 
 		 1478 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4344  glutamate synthase subunit alpha  32.98 
 
 		 1486 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0225673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2822  glutamate synthase (ferredoxin)  31.88 
 
 		 1518 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.857674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.77 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1226  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.92 
 
 		 1499 aa  126  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.27984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0535  putative glutamate synthase, large subunit  31.55 
 
 		 1478 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.684549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0585  glutamate synthase, large subunit, putative  32.11 
 
 		 1478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0586  putative glutamate synthase, large subunit  32.11 
 
 		 1478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  33.61 
 
 		 1486 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  31.12 
 
 		 1479 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004466  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.01 
 
 		 1516 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4791  putative glutamate synthase, large subunit  31.55 
 
 		 1478 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.621621  normal  0.701675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0498  glutamate synthase, large subunit  31.28 
 
 		 1478 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0441  glutamate synthase, NADPH, large subunit  32.11 
 
 		 1478 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0437  glutamate synthase, NADPH, large subunit  31.28 
 
 		 1478 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0530  glutamate synthase, large subunit  31.28 
 
 		 1478 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0513  putative glutamate synthase, large subunit  31.28 
 
 		 1478 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00928  glutamate synthase, large subunit  30.73 
 
 		 1516 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  32.16 
 
 		 1542 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2224  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.27 
 
 		 1519 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3227  ferredoxin-dependent glutamate synthase  29.83 
 
 		 514 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  32.78 
 
 		 1487 aa  124  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2942  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.62 
 
 		 1524 aa  124  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.290675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00926  glutamate synthase subunit alpha  32.77 
 
 		 1487 aa  123  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  31.11 
 
 		 1482 aa  123  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2711  glutamate synthase (ferredoxin)  32.05 
 
 		 1574 aa  123  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3552  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.93 
 
 		 516 aa  123  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  32.49 
 
 		 1487 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  32.85 
 
 		 1527 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  31.04 
 
 		 1508 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1952  glutamate synthase, large subunit  31.28 
 
 		 1530 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3748  glutamate synthase subunit alpha  33.82 
 
 		 1488 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956068  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  34.17 
 
 		 1486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2961  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.23 
 
 		 1536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.495295  normal  0.583434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2790  glutamate synthase subunit alpha  32.95 
 
 		 1482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0299  glutamate synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 1486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1253  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.16 
 
 		 1479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>