207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3676 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  63.55 
 
 		 961 aa  1009    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  68.67 
 
 		 546 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 772 aa  1573    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  78.62 
 
 		 573 aa  904    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  39.49 
 
 		 1015 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  39.15 
 
 		 988 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  39.62 
 
 		 988 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  38.72 
 
 		 988 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  38.72 
 
 		 988 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  38.72 
 
 		 988 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  38.72 
 
 		 988 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  38.72 
 
 		 988 aa  528  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  38.95 
 
 		 985 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  39 
 
 		 990 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  38.85 
 
 		 988 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  39 
 
 		 990 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  38.38 
 
 		 964 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  38.62 
 
 		 990 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  38.62 
 
 		 990 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  38.62 
 
 		 990 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  38.62 
 
 		 990 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  38.38 
 
 		 988 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  38.49 
 
 		 990 aa  519  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  37.61 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  37.61 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  38.08 
 
 		 989 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  38.03 
 
 		 989 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 988 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  37.95 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  37.95 
 
 		 988 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  38.21 
 
 		 988 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  39.29 
 
 		 755 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  38 
 
 		 988 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  38 
 
 		 988 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  38 
 
 		 988 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  38.39 
 
 		 996 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  36.57 
 
 		 994 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  36.57 
 
 		 994 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  36.57 
 
 		 862 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  38.55 
 
 		 996 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  38.55 
 
 		 996 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  38.55 
 
 		 996 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  36.54 
 
 		 994 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  35.25 
 
 		 988 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  36.26 
 
 		 988 aa  467  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  36.26 
 
 		 988 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  31.45 
 
 		 992 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  33.5 
 
 		 983 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  37.32 
 
 		 992 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 992 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  34.78 
 
 		 991 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  34.31 
 
 		 999 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  41.19 
 
 		 606 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  33.93 
 
 		 991 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  33.93 
 
 		 991 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  33.46 
 
 		 987 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  35.04 
 
 		 877 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  41.67 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  32.25 
 
 		 983 aa  369  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  50.35 
 
 		 305 aa  283  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  66.03 
 
 		 400 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  48.87 
 
 		 310 aa  263  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  41.18 
 
 		 338 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  28.5 
 
 		 924 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  28.5 
 
 		 976 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 		 731 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.39 
 
 		 1006 aa  245  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  36.39 
 
 		 371 aa  236  9e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.58 
 
 		 968 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  49.36 
 
 		 255 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  29.04 
 
 		 738 aa  227  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  29.93 
 
 		 613 aa  227  8e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  29.83 
 
 		 771 aa  226  9e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  26.54 
 
 		 997 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  41.48 
 
 		 273 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  45.5 
 
 		 246 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  45.05 
 
 		 246 aa  203  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  31.04 
 
 		 435 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  29.31 
 
 		 523 aa  195  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.82 
 
 		 1029 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  24.91 
 
 		 977 aa  188  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24.69 
 
 		 990 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  27.05 
 
 		 991 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  27.05 
 
 		 991 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  28.04 
 
 		 989 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 977 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 977 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  28.22 
 
 		 1026 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 1007 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  24.58 
 
 		 1007 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  28.22 
 
 		 1026 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.03 
 
 		 986 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  28.05 
 
 		 1028 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 999 aa  181  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 999 aa  181  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 999 aa  181  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 999 aa  181  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  28.05 
 
 		 1028 aa  180  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  53.75 
 
 		 358 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.05 
 
 		 990 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>