199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0079 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  76.3 
 
 		 771 aa  681    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  100 
 
 		 435 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  60.7 
 
 		 1006 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  58.55 
 
 		 997 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  55.4 
 
 		 991 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  55.4 
 
 		 991 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  51.06 
 
 		 1029 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  48.48 
 
 		 1028 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  47.13 
 
 		 1075 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  46.06 
 
 		 838 aa  293  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  38.46 
 
 		 988 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  36.71 
 
 		 983 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 988 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  37.91 
 
 		 988 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  37.91 
 
 		 988 aa  280  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 964 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  38.7 
 
 		 988 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  38.7 
 
 		 988 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  38.7 
 
 		 988 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  38.7 
 
 		 988 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  37.98 
 
 		 988 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  38.46 
 
 		 990 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  38.46 
 
 		 990 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 988 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  38.85 
 
 		 989 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  38.22 
 
 		 755 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 990 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 990 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 990 aa  275  9e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  38.22 
 
 		 988 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 990 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  38.22 
 
 		 990 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  37.14 
 
 		 989 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  36.93 
 
 		 988 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  36.93 
 
 		 988 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  39.44 
 
 		 924 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  39.44 
 
 		 976 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  36.6 
 
 		 988 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  36.6 
 
 		 606 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  36.6 
 
 		 988 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.7 
 
 		 987 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  37.04 
 
 		 985 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  35.93 
 
 		 994 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  35.93 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  35.93 
 
 		 994 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  35.93 
 
 		 862 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  34.44 
 
 		 1015 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  33.95 
 
 		 988 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  33.95 
 
 		 988 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  33.95 
 
 		 988 aa  252  8.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  34.12 
 
 		 991 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  34.12 
 
 		 991 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  38.81 
 
 		 338 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  35.7 
 
 		 994 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  47.62 
 
 		 916 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  31.4 
 
 		 992 aa  243  7e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  32.49 
 
 		 991 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  36.04 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  85.04 
 
 		 154 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  32.7 
 
 		 999 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  36.64 
 
 		 968 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  33.89 
 
 		 988 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  33.89 
 
 		 988 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  32.13 
 
 		 546 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  32.51 
 
 		 961 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 996 aa  220  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  34.28 
 
 		 992 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  34.28 
 
 		 992 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  33.09 
 
 		 996 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  33.09 
 
 		 996 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  31.15 
 
 		 988 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  33.09 
 
 		 996 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  36.73 
 
 		 305 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  31.26 
 
 		 573 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  30.97 
 
 		 772 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  30.24 
 
 		 983 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  37.63 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  38.37 
 
 		 246 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  38.37 
 
 		 246 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  29.24 
 
 		 1018 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  37.2 
 
 		 255 aa  169  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.76 
 
 		 986 aa  168  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  28.33 
 
 		 989 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  28.54 
 
 		 1019 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  28.09 
 
 		 993 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  28.09 
 
 		 993 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 1026 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 1026 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 		 1028 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  28.12 
 
 		 1028 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 		 990 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  28.5 
 
 		 1006 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  27.63 
 
 		 1019 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  27.29 
 
 		 1015 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  26.62 
 
 		 1004 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  26.62 
 
 		 1004 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  26.62 
 
 		 1004 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  26.29 
 
 		 929 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  27.07 
 
 		 1059 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  26.63 
 
 		 1013 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>