195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_24 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  100 
 
 
1019 aa  2103    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  31.81 
 
 
1019 aa  533  1e-150  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6928  transposase Tn3 family protein  30.75 
 
 
1027 aa  527  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  31.92 
 
 
1020 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  26.14 
 
 
1018 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  25.55 
 
 
1015 aa  284  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.15 
 
 
983 aa  265  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  24.61 
 
 
1028 aa  251  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  25.94 
 
 
987 aa  250  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  24.61 
 
 
1028 aa  249  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  24.61 
 
 
1026 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  24.61 
 
 
1026 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  24.2 
 
 
929 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  23.01 
 
 
992 aa  220  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  23.7 
 
 
992 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  24.01 
 
 
1006 aa  214  9e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  27.32 
 
 
988 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  27.32 
 
 
988 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.59 
 
 
997 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.97 
 
 
988 aa  204  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26.69 
 
 
988 aa  204  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26.69 
 
 
988 aa  204  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.48 
 
 
989 aa  204  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  32.59 
 
 
606 aa  204  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.21 
 
 
989 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  28.65 
 
 
994 aa  202  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23 
 
 
988 aa  202  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.63 
 
 
988 aa  201  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  34.16 
 
 
371 aa  200  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  28.36 
 
 
994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  28.36 
 
 
994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  28.36 
 
 
862 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.51 
 
 
988 aa  198  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.51 
 
 
988 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.51 
 
 
988 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.51 
 
 
988 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  27 
 
 
985 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.51 
 
 
990 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  26.26 
 
 
1015 aa  196  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.51 
 
 
990 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.2 
 
 
988 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.2 
 
 
988 aa  195  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.21 
 
 
999 aa  195  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.81 
 
 
964 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 
990 aa  194  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 
990 aa  194  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 
990 aa  194  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 
990 aa  193  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.8 
 
 
988 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  29.32 
 
 
550 aa  193  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26.55 
 
 
988 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.51 
 
 
990 aa  193  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.4 
 
 
755 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  21.97 
 
 
976 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  26.63 
 
 
988 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  26.63 
 
 
988 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  26.63 
 
 
988 aa  191  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6457  transposase Tn3  21.82 
 
 
1008 aa  191  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.17 
 
 
996 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.42 
 
 
996 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.17 
 
 
996 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.17 
 
 
996 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.66 
 
 
988 aa  188  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.64 
 
 
1006 aa  188  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.14 
 
 
991 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.14 
 
 
991 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 
924 aa  187  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  35.06 
 
 
338 aa  187  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.14 
 
 
992 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.14 
 
 
992 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4353  transposase Tn3 family protein  21.74 
 
 
1010 aa  186  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4490  transposase Tn3 family protein  21.74 
 
 
1010 aa  186  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.666147  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.75 
 
 
991 aa  183  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  20.97 
 
 
968 aa  182  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1476  transposase Tn3 family protein  21.77 
 
 
1009 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000034033 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4478  transposase Tn3 family protein  21.77 
 
 
1009 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000650614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1851  transposase Tn3 family protein  21.77 
 
 
1009 aa  177  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000277691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5340  transposase  21.77 
 
 
1009 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.06 
 
 
1029 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  28.26 
 
 
961 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  36.03 
 
 
305 aa  166  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  28.54 
 
 
435 aa  165  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.54 
 
 
546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  27.65 
 
 
771 aa  164  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  33.9 
 
 
310 aa  160  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 
983 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 
988 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 
988 aa  155  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 
772 aa  153  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  37.89 
 
 
246 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  37.55 
 
 
246 aa  147  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.4 
 
 
573 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  20.16 
 
 
986 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.5 
 
 
990 aa  144  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  21.43 
 
 
989 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  20.12 
 
 
991 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  20.12 
 
 
991 aa  142  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  35.98 
 
 
255 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3469  transposase Tn3 family protein  21.98 
 
 
883 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
994 aa  139  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>