203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4775 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 838 aa  1683    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  57.76 
 
 		 1028 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  37.94 
 
 		 771 aa  351  4e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  54.15 
 
 		 1075 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  52.13 
 
 		 1006 aa  329  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  53.12 
 
 		 997 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  32.36 
 
 		 1029 aa  326  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  50.79 
 
 		 991 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  50.79 
 
 		 991 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  46.06 
 
 		 435 aa  293  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  45.54 
 
 		 916 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.1 
 
 		 994 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.1 
 
 		 862 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.1 
 
 		 994 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.44 
 
 		 992 aa  178  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  27.51 
 
 		 996 aa  177  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  26.78 
 
 		 996 aa  177  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  26.78 
 
 		 996 aa  177  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  26.78 
 
 		 996 aa  177  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  34.67 
 
 		 371 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.91 
 
 		 991 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.91 
 
 		 991 aa  173  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  32.72 
 
 		 983 aa  172  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  33.54 
 
 		 338 aa  172  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  35.33 
 
 		 988 aa  170  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  34.81 
 
 		 988 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  34.69 
 
 		 987 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  34.18 
 
 		 988 aa  167  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  34.18 
 
 		 964 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  35.11 
 
 		 988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  35.11 
 
 		 988 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  34.49 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  34.49 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  34.49 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  34.49 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.93 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.93 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.93 
 
 		 988 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  34.06 
 
 		 990 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  34.06 
 
 		 990 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  34.37 
 
 		 755 aa  164  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.66 
 
 		 924 aa  164  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  34.37 
 
 		 990 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  34.37 
 
 		 990 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  34.37 
 
 		 990 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  33.86 
 
 		 988 aa  164  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  33.66 
 
 		 976 aa  163  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  34.37 
 
 		 990 aa  163  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  35.11 
 
 		 988 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  34.07 
 
 		 988 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  35.11 
 
 		 988 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  33.54 
 
 		 988 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  33.54 
 
 		 988 aa  161  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  34.06 
 
 		 990 aa  161  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  35.11 
 
 		 606 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.91 
 
 		 993 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.91 
 
 		 993 aa  160  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  34.38 
 
 		 989 aa  160  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  32.82 
 
 		 989 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  34.38 
 
 		 985 aa  157  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  35.94 
 
 		 310 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  30.83 
 
 		 550 aa  153  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  25.13 
 
 		 961 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.23 
 
 		 991 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 		 983 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  31.74 
 
 		 1015 aa  151  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 994 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  31.83 
 
 		 305 aa  148  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  30.92 
 
 		 999 aa  147  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  36.9 
 
 		 255 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.39 
 
 		 989 aa  144  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  27.5 
 
 		 546 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  33.55 
 
 		 994 aa  143  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  35.34 
 
 		 246 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  35.34 
 
 		 246 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  30.36 
 
 		 988 aa  137  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  52.31 
 
 		 154 aa  131  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  20.03 
 
 		 995 aa  129  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  25.32 
 
 		 988 aa  128  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.07 
 
 		 968 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.21 
 
 		 986 aa  124  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4667  transposase  59.38 
 
 		 123 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  28.61 
 
 		 988 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  28.61 
 
 		 988 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  27.05 
 
 		 1019 aa  121  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  25.89 
 
 		 1018 aa  120  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  27.09 
 
 		 990 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 772 aa  120  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  31.43 
 
 		 992 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  31.43 
 
 		 992 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  26.67 
 
 		 1019 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  33.18 
 
 		 217 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  28.21 
 
 		 573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  37.31 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  23.53 
 
 		 1015 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  29.41 
 
 		 990 aa  108  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  24.14 
 
 		 989 aa  108  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3466  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 		 992 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  35.68 
 
 		 224 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 1006 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>