214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0030 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  78.41 
 
 
988 aa  956    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  78.41 
 
 
988 aa  956    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  76.21 
 
 
989 aa  923    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  80.48 
 
 
988 aa  974    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  80.31 
 
 
988 aa  975    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  75.82 
 
 
1015 aa  922    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  79.45 
 
 
988 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  78.29 
 
 
989 aa  958    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  79.45 
 
 
988 aa  974    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  78.31 
 
 
755 aa  950    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  79.45 
 
 
988 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  79.45 
 
 
988 aa  974    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  100 
 
 
988 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  75.09 
 
 
985 aa  925    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
988 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
988 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
988 aa  842    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  79.62 
 
 
988 aa  969    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  79.11 
 
 
964 aa  971    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  78.49 
 
 
990 aa  951    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  78.49 
 
 
990 aa  951    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  78.49 
 
 
990 aa  951    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  96.75 
 
 
988 aa  1163    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  96.75 
 
 
988 aa  1163    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  78.31 
 
 
990 aa  950    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  100 
 
 
606 aa  1236    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  79.62 
 
 
988 aa  974    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  99.32 
 
 
988 aa  1189    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  78.31 
 
 
990 aa  950    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  78.94 
 
 
988 aa  968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  60.93 
 
 
994 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  61.67 
 
 
550 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  60.93 
 
 
994 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  60.93 
 
 
862 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  79 
 
 
990 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  79 
 
 
990 aa  955    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  61.1 
 
 
994 aa  719    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  48.88 
 
 
992 aa  628  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  51.11 
 
 
996 aa  601  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  50.6 
 
 
996 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  50.6 
 
 
996 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  50.6 
 
 
996 aa  590  1e-167  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  99.3 
 
 
310 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  46.89 
 
 
988 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  48.79 
 
 
988 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  48.79 
 
 
988 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  48.7 
 
 
992 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  48.7 
 
 
992 aa  533  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  99.61 
 
 
255 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  44.27 
 
 
987 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  45.31 
 
 
999 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  44.1 
 
 
983 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  44.54 
 
 
991 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  44.81 
 
 
991 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  44.81 
 
 
991 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  77.03 
 
 
305 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  44.7 
 
 
961 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  46.61 
 
 
546 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  44.1 
 
 
573 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  41.19 
 
 
772 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  41.72 
 
 
983 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  62.76 
 
 
731 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  99 
 
 
203 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  44.49 
 
 
877 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  49.59 
 
 
371 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.53 
 
 
338 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  61.65 
 
 
273 aa  336  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  37.63 
 
 
924 aa  333  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  37.63 
 
 
976 aa  333  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.52 
 
 
771 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  34.26 
 
 
1006 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  36.58 
 
 
968 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  35.64 
 
 
997 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  87.43 
 
 
339 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  86.83 
 
 
264 aa  282  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.42 
 
 
246 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.42 
 
 
246 aa  280  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.18 
 
 
161 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  29.54 
 
 
989 aa  267  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.6 
 
 
435 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  65.2 
 
 
224 aa  266  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  32.84 
 
 
1029 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  32.72 
 
 
991 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  32.72 
 
 
991 aa  261  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  30.32 
 
 
986 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  31.99 
 
 
1028 aa  246  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  30.29 
 
 
990 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  30.7 
 
 
990 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  30.25 
 
 
999 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  30.25 
 
 
999 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  30.25 
 
 
999 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  30.25 
 
 
999 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  30.69 
 
 
1059 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  30.82 
 
 
1075 aa  237  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  29.91 
 
 
994 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  30.41 
 
 
993 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  30.41 
 
 
993 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  30.66 
 
 
1007 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  30.66 
 
 
1007 aa  228  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  28.17 
 
 
1012 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>