187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3715 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  62.97 
 
 
988 aa  926    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  58.5 
 
 
988 aa  848    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  58.5 
 
 
988 aa  848    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  61.96 
 
 
989 aa  913    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  61.53 
 
 
988 aa  907    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  58.71 
 
 
1015 aa  864    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  57.27 
 
 
988 aa  816    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  59.8 
 
 
988 aa  875    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  63.54 
 
 
988 aa  926    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  63.26 
 
 
989 aa  924    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  60.23 
 
 
985 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  64.57 
 
 
755 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  63.54 
 
 
988 aa  926    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  63.54 
 
 
988 aa  926    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  61.36 
 
 
526 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  51.15 
 
 
988 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  51.15 
 
 
988 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  51.15 
 
 
988 aa  697    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  60.95 
 
 
964 aa  883    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
731 aa  1512    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  62.59 
 
 
990 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  62.59 
 
 
990 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  62.59 
 
 
990 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  57.55 
 
 
988 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  57.27 
 
 
988 aa  821    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  57.27 
 
 
988 aa  821    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  62.45 
 
 
990 aa  916    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  62.68 
 
 
988 aa  918    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  62.59 
 
 
990 aa  918    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  63.54 
 
 
988 aa  926    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  46.33 
 
 
994 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  46.47 
 
 
994 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  63.6 
 
 
990 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  47.05 
 
 
994 aa  676    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  63.6 
 
 
990 aa  926    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  62.54 
 
 
988 aa  915    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  41.18 
 
 
992 aa  587  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  47.86 
 
 
862 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  40.17 
 
 
996 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  39.89 
 
 
996 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  40.17 
 
 
996 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  40.17 
 
 
996 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  36.36 
 
 
983 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  34.49 
 
 
738 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.4 
 
 
987 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  35.73 
 
 
988 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  35.63 
 
 
992 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  35.63 
 
 
992 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  62.76 
 
 
606 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  33.14 
 
 
877 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  35.55 
 
 
988 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  35.4 
 
 
988 aa  389  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  34.54 
 
 
612 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  42.92 
 
 
440 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  32.47 
 
 
991 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  32.47 
 
 
991 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  34.38 
 
 
613 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  33.09 
 
 
999 aa  378  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  31.37 
 
 
991 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  32.62 
 
 
961 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  33.65 
 
 
523 aa  343  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  30.79 
 
 
983 aa  336  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  52.8 
 
 
550 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 
968 aa  250  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  30.34 
 
 
772 aa  243  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  27.48 
 
 
1006 aa  230  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  27.92 
 
 
976 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.26 
 
 
997 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  29.38 
 
 
924 aa  221  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  57.14 
 
 
273 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  54.39 
 
 
171 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  31.75 
 
 
400 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
991 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
991 aa  191  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  32 
 
 
358 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.67 
 
 
1028 aa  180  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  26.23 
 
 
1075 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  25.11 
 
 
916 aa  172  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.96 
 
 
969 aa  170  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  33.56 
 
 
573 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.23 
 
 
974 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  23.96 
 
 
1029 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  36.36 
 
 
546 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
999 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
999 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
999 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
999 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  36.49 
 
 
771 aa  138  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  22.83 
 
 
1059 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.14 
 
 
1004 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.14 
 
 
1004 aa  135  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  23.71 
 
 
1007 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  23.71 
 
 
1007 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 
950 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  23.8 
 
 
874 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  22.34 
 
 
986 aa  125  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  23.57 
 
 
1012 aa  125  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  23.66 
 
 
969 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.31 
 
 
990 aa  124  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  24.72 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>