222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0111 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  49.95 
 
 
1006 aa  909    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  41.99 
 
 
1075 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  64.79 
 
 
991 aa  1264    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  64.79 
 
 
991 aa  1264    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  49.36 
 
 
1029 aa  899    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  42.25 
 
 
1028 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  100 
 
 
997 aa  2013    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  53.31 
 
 
771 aa  628  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  41.3 
 
 
916 aa  546  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  58.55 
 
 
435 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  30.94 
 
 
987 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.04 
 
 
983 aa  445  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  30.98 
 
 
988 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  30.98 
 
 
988 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.51 
 
 
992 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  30.23 
 
 
988 aa  393  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  30.37 
 
 
988 aa  392  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  30.23 
 
 
988 aa  393  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  30.41 
 
 
989 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  30.61 
 
 
988 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  30.23 
 
 
988 aa  393  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  30.23 
 
 
988 aa  393  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  31.06 
 
 
988 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.75 
 
 
988 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.75 
 
 
988 aa  391  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  31.29 
 
 
988 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  30.46 
 
 
988 aa  389  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  31.09 
 
 
988 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  30.32 
 
 
990 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  30.32 
 
 
990 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.96 
 
 
988 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  30.01 
 
 
989 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  30.17 
 
 
990 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
990 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
990 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
990 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
990 aa  379  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
994 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  29.9 
 
 
994 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  29.82 
 
 
964 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  363  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  363  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
988 aa  363  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  30.01 
 
 
1015 aa  361  4e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 
994 aa  361  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  29.14 
 
 
985 aa  360  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  30.03 
 
 
862 aa  353  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  53.12 
 
 
838 aa  330  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  30.58 
 
 
996 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.4 
 
 
996 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  30.58 
 
 
996 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  30.58 
 
 
996 aa  328  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.59 
 
 
976 aa  326  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  31.45 
 
 
755 aa  321  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.06 
 
 
991 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.06 
 
 
991 aa  319  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 
924 aa  319  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  30.04 
 
 
968 aa  318  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 
988 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 
988 aa  310  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  35.64 
 
 
606 aa  298  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  28.19 
 
 
991 aa  297  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  28.73 
 
 
999 aa  295  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  29.42 
 
 
992 aa  295  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  29.42 
 
 
992 aa  295  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  27.17 
 
 
961 aa  283  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  26.92 
 
 
988 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  34.66 
 
 
550 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  27.25 
 
 
983 aa  273  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  42.01 
 
 
338 aa  269  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  39.52 
 
 
371 aa  254  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  49.66 
 
 
492 aa  253  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  22.69 
 
 
990 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  26.53 
 
 
738 aa  240  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.48 
 
 
986 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.73 
 
 
993 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.73 
 
 
993 aa  233  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  27.38 
 
 
877 aa  229  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  27.26 
 
 
731 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.82 
 
 
989 aa  220  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.7 
 
 
994 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.9 
 
 
772 aa  219  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
969 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.61 
 
 
990 aa  214  7.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  33 
 
 
546 aa  214  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  26.04 
 
 
613 aa  210  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  26.76 
 
 
612 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.22 
 
 
995 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  24.49 
 
 
1018 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  22.59 
 
 
1019 aa  205  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  29.68 
 
 
573 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  25.43 
 
 
989 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  20.63 
 
 
995 aa  202  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  25.21 
 
 
950 aa  201  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  43.27 
 
 
246 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  42.86 
 
 
246 aa  197  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  26.01 
 
 
979 aa  196  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3764  Tn3 family transposase  67.72 
 
 
154 aa  193  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  24.08 
 
 
1006 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  37.5 
 
 
305 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>