222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4554 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  37.84 
 
 
1015 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  38.11 
 
 
988 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  38.11 
 
 
988 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  37.32 
 
 
989 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  39.76 
 
 
996 aa  667    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  35.7 
 
 
992 aa  650    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  38.24 
 
 
990 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  75.68 
 
 
999 aa  1512    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  39.09 
 
 
988 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  38.58 
 
 
988 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  38.24 
 
 
989 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  38.13 
 
 
990 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  38.58 
 
 
988 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  38.58 
 
 
988 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 
985 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  100 
 
 
991 aa  2026    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  100 
 
 
991 aa  2026    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  37.84 
 
 
988 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  40.51 
 
 
996 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  38.17 
 
 
964 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
990 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
990 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
990 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  38.02 
 
 
988 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  38.12 
 
 
988 aa  659    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  38.02 
 
 
988 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
990 aa  656    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  74.57 
 
 
991 aa  1506    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  43.42 
 
 
988 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  40.51 
 
 
996 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  40.51 
 
 
996 aa  671    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  38.58 
 
 
988 aa  660    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  38.58 
 
 
988 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  38.48 
 
 
988 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  37.8 
 
 
988 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  38.12 
 
 
988 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  38.98 
 
 
988 aa  671    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  43.42 
 
 
988 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  38.13 
 
 
990 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  40.89 
 
 
877 aa  629  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 
988 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 
988 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 
988 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  38.65 
 
 
992 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  38.65 
 
 
992 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  35.03 
 
 
994 aa  594  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  34.52 
 
 
994 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  34.52 
 
 
994 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  35.99 
 
 
961 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  39.87 
 
 
755 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  32.5 
 
 
983 aa  529  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  35.25 
 
 
862 aa  526  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  31.82 
 
 
987 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  44.81 
 
 
606 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  33.83 
 
 
983 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  42.03 
 
 
550 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  33.93 
 
 
772 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  42.77 
 
 
546 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  32.47 
 
 
731 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  30.42 
 
 
1006 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  41.25 
 
 
573 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.58 
 
 
976 aa  330  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  28.06 
 
 
997 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  31.32 
 
 
924 aa  322  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  52.8 
 
 
310 aa  301  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.94 
 
 
968 aa  294  5e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  43.67 
 
 
338 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  26.68 
 
 
738 aa  282  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  49.31 
 
 
305 aa  280  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  55.12 
 
 
255 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  27.32 
 
 
1028 aa  273  8.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  37.84 
 
 
371 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  26.87 
 
 
991 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  26.87 
 
 
991 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  29.3 
 
 
771 aa  252  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  34.12 
 
 
435 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  30.99 
 
 
526 aa  248  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  27 
 
 
612 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  24.8 
 
 
974 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  26.95 
 
 
1075 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  46.12 
 
 
246 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  45.71 
 
 
246 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  26.58 
 
 
969 aa  227  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  56.85 
 
 
203 aa  221  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  32.65 
 
 
1029 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  24.6 
 
 
1007 aa  218  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  24.6 
 
 
1007 aa  218  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  25.28 
 
 
988 aa  217  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  25.92 
 
 
613 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  25.36 
 
 
989 aa  216  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.92 
 
 
993 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.92 
 
 
993 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.11 
 
 
995 aa  213  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  23.59 
 
 
1015 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24 
 
 
990 aa  208  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  53.92 
 
 
224 aa  207  6e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  25.98 
 
 
1012 aa  207  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  24.85 
 
 
989 aa  207  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  26.02 
 
 
1059 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 
995 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>