199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3661 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  45.4 
 
 		 815 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  40.06 
 
 		 1009 aa  708    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 950 aa  1959    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  62.55 
 
 		 969 aa  1241    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  50.63 
 
 		 988 aa  950    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  44.43 
 
 		 874 aa  708    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  48.88 
 
 		 974 aa  927    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  46.11 
 
 		 969 aa  851    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  60.84 
 
 		 412 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  65.55 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  41.13 
 
 		 659 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  36.57 
 
 		 570 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  27.45 
 
 		 1015 aa  277  6e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  33.64 
 
 		 499 aa  271  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  33.64 
 
 		 499 aa  271  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.68 
 
 		 990 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  24.5 
 
 		 1004 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  24.5 
 
 		 1004 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  25.24 
 
 		 1007 aa  260  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  25.24 
 
 		 1007 aa  260  9e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  27.04 
 
 		 1006 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  25.5 
 
 		 988 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  25.62 
 
 		 988 aa  256  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  25.83 
 
 		 988 aa  252  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  24.26 
 
 		 1006 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  24.26 
 
 		 1006 aa  251  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  25.32 
 
 		 988 aa  251  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  25.32 
 
 		 988 aa  251  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  25.32 
 
 		 988 aa  251  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  25.32 
 
 		 988 aa  251  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  25.78 
 
 		 988 aa  250  9e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25 
 
 		 983 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.6 
 
 		 994 aa  248  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  25.62 
 
 		 990 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  25.62 
 
 		 990 aa  247  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.65 
 
 		 988 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  25.29 
 
 		 989 aa  246  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  24.61 
 
 		 1004 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  24.74 
 
 		 1059 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  26.02 
 
 		 989 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 		 990 aa  245  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 		 964 aa  243  9e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 990 aa  243  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 990 aa  243  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 990 aa  243  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.51 
 
 		 990 aa  242  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  25.99 
 
 		 988 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.92 
 
 		 988 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.92 
 
 		 988 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  25.71 
 
 		 988 aa  241  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 		 988 aa  240  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 		 988 aa  240  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.71 
 
 		 988 aa  239  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  25.14 
 
 		 985 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.28 
 
 		 987 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  23.89 
 
 		 995 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.39 
 
 		 992 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  23.38 
 
 		 986 aa  236  2.0000000000000002e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 		 994 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 		 994 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24.15 
 
 		 990 aa  234  6e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  24.53 
 
 		 1013 aa  233  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  23.15 
 
 		 995 aa  231  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.99 
 
 		 862 aa  230  8e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  25.2 
 
 		 989 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.74 
 
 		 993 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.95 
 
 		 988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.95 
 
 		 988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.95 
 
 		 988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.74 
 
 		 993 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.29 
 
 		 1012 aa  219  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  26.3 
 
 		 988 aa  218  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  50.24 
 
 		 365 aa  217  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.19 
 
 		 988 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  24.63 
 
 		 1028 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  28.05 
 
 		 994 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.71 
 
 		 755 aa  212  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 		 996 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  25.1 
 
 		 997 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  28.52 
 
 		 550 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 		 996 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 		 996 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.04 
 
 		 992 aa  204  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.04 
 
 		 992 aa  204  7e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  29.35 
 
 		 606 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  26.11 
 
 		 996 aa  199  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.67 
 
 		 961 aa  191  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  23.55 
 
 		 991 aa  183  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  23.55 
 
 		 991 aa  183  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.82 
 
 		 991 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.82 
 
 		 991 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  23.46 
 
 		 877 aa  172  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  24.72 
 
 		 977 aa  167  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.6 
 
 		 976 aa  166  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  23.74 
 
 		 977 aa  163  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  23.74 
 
 		 977 aa  163  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>