193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2367 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  100 
 
 		 815 aa  1655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  47.77 
 
 		 974 aa  769    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  45.4 
 
 		 950 aa  689    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  43.11 
 
 		 969 aa  685    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  51.15 
 
 		 988 aa  777    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  60.2 
 
 		 1009 aa  939    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  45.56 
 
 		 969 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  43.79 
 
 		 874 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  50.49 
 
 		 412 aa  425  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  94.31 
 
 		 365 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  55.59 
 
 		 332 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  44.01 
 
 		 659 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  42.66 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.14 
 
 		 990 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.41 
 
 		 986 aa  208  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 		 1007 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 		 1007 aa  206  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.98 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.98 
 
 		 1004 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  23.24 
 
 		 995 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  25.87 
 
 		 1006 aa  194  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  22.87 
 
 		 995 aa  193  9e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  23.82 
 
 		 1004 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  32.31 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  32.31 
 
 		 499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.81 
 
 		 1012 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.84 
 
 		 988 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.53 
 
 		 964 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.53 
 
 		 988 aa  181  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.43 
 
 		 988 aa  181  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  25.04 
 
 		 994 aa  180  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.1 
 
 		 999 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 		 1015 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.18 
 
 		 989 aa  177  6e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  22.76 
 
 		 983 aa  177  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.97 
 
 		 991 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.97 
 
 		 991 aa  177  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.5 
 
 		 988 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  25.61 
 
 		 1059 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 		 1028 aa  174  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 		 988 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 		 988 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 		 988 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.8 
 
 		 988 aa  174  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.8 
 
 		 988 aa  174  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.8 
 
 		 988 aa  174  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.8 
 
 		 988 aa  174  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  26.77 
 
 		 1006 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  26.77 
 
 		 1006 aa  173  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.7 
 
 		 993 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.7 
 
 		 993 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.22 
 
 		 989 aa  170  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 990 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 990 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 990 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.12 
 
 		 988 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.12 
 
 		 988 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 		 994 aa  169  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.86 
 
 		 989 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 990 aa  169  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 990 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  23.9 
 
 		 988 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.01 
 
 		 992 aa  167  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 		 985 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  25.09 
 
 		 988 aa  165  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  25.09 
 
 		 988 aa  165  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  23.63 
 
 		 1013 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.69 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  25.19 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 		 976 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.79 
 
 		 994 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  23.79 
 
 		 994 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.79 
 
 		 862 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.34 
 
 		 924 aa  162  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  25.31 
 
 		 771 aa  162  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.16 
 
 		 990 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.16 
 
 		 990 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.3 
 
 		 988 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.39 
 
 		 606 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.76 
 
 		 990 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.29 
 
 		 755 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 		 988 aa  153  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.53 
 
 		 999 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 		 988 aa  151  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  25.54 
 
 		 991 aa  151  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  27.06 
 
 		 977 aa  150  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.91 
 
 		 961 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 968 aa  146  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.37 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.11 
 
 		 987 aa  144  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 		 977 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 		 977 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.69 
 
 		 996 aa  140  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.33 
 
 		 997 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  27.67 
 
 		 338 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 996 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.49 
 
 		 996 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>