194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3614 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  42.43 
 
 
988 aa  738    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  60.2 
 
 
815 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  40.16 
 
 
950 aa  688    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  38.08 
 
 
969 aa  702    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  37.52 
 
 
974 aa  695    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
1009 aa  2071    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  38.08 
 
 
969 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  36.87 
 
 
874 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  38.91 
 
 
659 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  46.62 
 
 
412 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  48.3 
 
 
332 aa  308  4.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  35.12 
 
 
570 aa  306  9.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  68.06 
 
 
365 aa  287  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0237  transposase, putative  30.65 
 
 
499 aa  260  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0198  transposase, putative  30.65 
 
 
499 aa  260  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.75 
 
 
1004 aa  181  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.75 
 
 
1004 aa  181  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.02 
 
 
988 aa  180  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  23.88 
 
 
1004 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.84 
 
 
992 aa  173  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.63 
 
 
961 aa  166  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.64 
 
 
985 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  22.84 
 
 
1007 aa  161  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  22.84 
 
 
1007 aa  161  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  21.17 
 
 
983 aa  160  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  22.22 
 
 
1015 aa  157  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.71 
 
 
1006 aa  155  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.68 
 
 
987 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.39 
 
 
988 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.39 
 
 
988 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  27.47 
 
 
1059 aa  151  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.75 
 
 
990 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  21.9 
 
 
988 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  21.9 
 
 
988 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  21.9 
 
 
988 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.75 
 
 
990 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  21.9 
 
 
988 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.14 
 
 
988 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.36 
 
 
995 aa  148  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  23.01 
 
 
999 aa  148  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  23.01 
 
 
999 aa  148  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  23.01 
 
 
999 aa  148  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  23.01 
 
 
999 aa  148  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  20.18 
 
 
1006 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  20.18 
 
 
1006 aa  147  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.04 
 
 
988 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.48 
 
 
990 aa  147  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
990 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
990 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
990 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.26 
 
 
993 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.26 
 
 
993 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  22.26 
 
 
988 aa  145  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  21.76 
 
 
988 aa  145  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  21.19 
 
 
988 aa  145  4e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.68 
 
 
990 aa  145  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.32 
 
 
986 aa  144  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  22.21 
 
 
990 aa  144  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.66 
 
 
999 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.15 
 
 
988 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  21.4 
 
 
988 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.91 
 
 
1012 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  22.41 
 
 
994 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.17 
 
 
988 aa  142  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.17 
 
 
988 aa  142  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.15 
 
 
988 aa  142  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.93 
 
 
991 aa  141  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.93 
 
 
991 aa  141  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.24 
 
 
989 aa  141  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  27.37 
 
 
1013 aa  140  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  20.06 
 
 
995 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  21.29 
 
 
989 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1787  hypothetical protein  31.32 
 
 
319 aa  134  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
994 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.67 
 
 
991 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  27.4 
 
 
1028 aa  131  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 
988 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 
988 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  22.8 
 
 
988 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.22 
 
 
968 aa  130  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.71 
 
 
994 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.71 
 
 
994 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  21.87 
 
 
988 aa  130  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  22.73 
 
 
862 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  25.86 
 
 
606 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.86 
 
 
964 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  23.5 
 
 
976 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25 
 
 
550 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 
924 aa  124  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  24.04 
 
 
977 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  24.04 
 
 
977 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  22.92 
 
 
877 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  22.09 
 
 
990 aa  122  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  23.07 
 
 
755 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  20.85 
 
 
989 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  24.5 
 
 
771 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  24.85 
 
 
338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  25.44 
 
 
977 aa  118  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  27.22 
 
 
996 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  27.22 
 
 
996 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>