229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2679 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  78.48 
 
 
988 aa  1605    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  78.48 
 
 
988 aa  1605    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  81.82 
 
 
989 aa  1693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  41.31 
 
 
988 aa  697    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  39.59 
 
 
961 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  47.18 
 
 
996 aa  894    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  40.71 
 
 
983 aa  766    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  96.26 
 
 
990 aa  1969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  44.23 
 
 
992 aa  929    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  78.6 
 
 
985 aa  1609    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  78.31 
 
 
606 aa  950    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  55.58 
 
 
994 aa  1087    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  38.2 
 
 
991 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  41.32 
 
 
988 aa  751    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  47.02 
 
 
996 aa  886    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  83.74 
 
 
988 aa  1697    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  87.07 
 
 
988 aa  1789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  88.28 
 
 
989 aa  1811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  43.52 
 
 
992 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  43.52 
 
 
992 aa  771    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  99.47 
 
 
755 aa  1543    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  87.07 
 
 
988 aa  1789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  87.07 
 
 
988 aa  1789    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  87.07 
 
 
988 aa  1789    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  38.24 
 
 
991 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  38.24 
 
 
991 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  99.42 
 
 
526 aa  1054    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  41.31 
 
 
988 aa  698    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  47.02 
 
 
996 aa  886    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  86.97 
 
 
988 aa  1789    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  59.39 
 
 
988 aa  1178    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  59.39 
 
 
988 aa  1178    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  59.39 
 
 
988 aa  1178    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  84.44 
 
 
988 aa  1725    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  85.15 
 
 
964 aa  1729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  40.18 
 
 
987 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  62.59 
 
 
731 aa  918    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  99.49 
 
 
990 aa  2023    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  99.49 
 
 
990 aa  2023    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  99.49 
 
 
990 aa  2023    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  72.28 
 
 
988 aa  1454    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  71.57 
 
 
988 aa  1444    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  71.57 
 
 
988 aa  1444    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  99.19 
 
 
990 aa  2014    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  70.48 
 
 
1015 aa  1443    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
990 aa  2034    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  47.02 
 
 
996 aa  886    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  86.77 
 
 
988 aa  1782    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  87.27 
 
 
988 aa  1784    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  71.88 
 
 
988 aa  1444    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.64 
 
 
999 aa  650    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  55.07 
 
 
994 aa  1092    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  63.9 
 
 
550 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  55.17 
 
 
994 aa  1093    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  57.38 
 
 
862 aa  997    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  96.26 
 
 
990 aa  1969    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  37.94 
 
 
877 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  35.84 
 
 
983 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  38.49 
 
 
772 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  83.75 
 
 
310 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  75.17 
 
 
305 aa  459  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  46.63 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  83.67 
 
 
255 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  41.17 
 
 
573 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  33.91 
 
 
738 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.36 
 
 
1006 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 
968 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.17 
 
 
997 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  34.62 
 
 
612 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  48.79 
 
 
371 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  32.07 
 
 
976 aa  373  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  44.06 
 
 
440 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  32.67 
 
 
924 aa  359  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  34.33 
 
 
613 aa  356  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.36 
 
 
991 aa  355  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.36 
 
 
991 aa  355  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 
273 aa  350  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.37 
 
 
338 aa  342  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  93.02 
 
 
339 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  83.42 
 
 
203 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  34.04 
 
 
523 aa  321  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.23 
 
 
771 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  91.28 
 
 
264 aa  311  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  28.85 
 
 
1029 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  29.64 
 
 
1028 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  28.31 
 
 
1075 aa  304  5.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  91.93 
 
 
161 aa  301  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.27 
 
 
989 aa  296  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.79 
 
 
986 aa  293  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  26.54 
 
 
990 aa  284  5.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  68.66 
 
 
224 aa  281  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 
990 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.63 
 
 
246 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.63 
 
 
246 aa  275  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  26.05 
 
 
1013 aa  275  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  38.22 
 
 
435 aa  274  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  26.7 
 
 
993 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  26.7 
 
 
993 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  24.56 
 
 
974 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.97 
 
 
999 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>