215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0346 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  50.41 
 
 
924 aa  756    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  49.21 
 
 
976 aa  803    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
968 aa  1945    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  57.52 
 
 
423 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  33.5 
 
 
988 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  33.61 
 
 
988 aa  437  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.3 
 
 
983 aa  432  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  32.99 
 
 
988 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  30.63 
 
 
987 aa  432  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  32.99 
 
 
988 aa  429  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  33.3 
 
 
988 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  32.99 
 
 
988 aa  429  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  32.99 
 
 
988 aa  429  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  32.99 
 
 
988 aa  429  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  33.3 
 
 
964 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  32.86 
 
 
989 aa  426  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  32.27 
 
 
988 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  32.27 
 
 
988 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  32.68 
 
 
988 aa  412  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  32.99 
 
 
990 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  32.99 
 
 
990 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  32.13 
 
 
1015 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  32.44 
 
 
988 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  32.65 
 
 
988 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  32.65 
 
 
988 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  32.65 
 
 
988 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  32.11 
 
 
985 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 
990 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  32.48 
 
 
990 aa  403  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  32.48 
 
 
990 aa  403  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  32.48 
 
 
990 aa  403  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  32.24 
 
 
988 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  32.24 
 
 
988 aa  401  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  32.48 
 
 
990 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  32.44 
 
 
988 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  31.05 
 
 
989 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.51 
 
 
992 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.22 
 
 
1006 aa  378  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 
994 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 
994 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  31.15 
 
 
994 aa  362  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.79 
 
 
996 aa  351  3e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  32.96 
 
 
988 aa  342  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  32.96 
 
 
988 aa  341  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  30.93 
 
 
996 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  30.93 
 
 
996 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  30.93 
 
 
996 aa  337  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  34.44 
 
 
755 aa  336  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  29.65 
 
 
997 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  32.7 
 
 
877 aa  332  3e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  30.74 
 
 
992 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  30.74 
 
 
992 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  30.91 
 
 
862 aa  320  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.37 
 
 
988 aa  316  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  29.64 
 
 
983 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  28.29 
 
 
991 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  29.65 
 
 
961 aa  303  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  28.76 
 
 
999 aa  301  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  36.58 
 
 
606 aa  301  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  28.98 
 
 
991 aa  300  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  28.98 
 
 
991 aa  300  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 
991 aa  300  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.4 
 
 
991 aa  300  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  36.1 
 
 
550 aa  264  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  27.24 
 
 
1018 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 
731 aa  260  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  28.41 
 
 
738 aa  260  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.21 
 
 
771 aa  253  9.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  27.73 
 
 
1029 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  27.78 
 
 
1075 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  25.8 
 
 
929 aa  237  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  29.42 
 
 
772 aa  234  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.03 
 
 
986 aa  229  3e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  23.91 
 
 
1015 aa  229  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.64 
 
 
435 aa  228  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 
612 aa  227  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  34.5 
 
 
573 aa  225  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  29.22 
 
 
613 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  37.35 
 
 
371 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  26.26 
 
 
1028 aa  213  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  26.15 
 
 
1028 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  26.6 
 
 
1026 aa  212  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  26.6 
 
 
1026 aa  212  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  27.07 
 
 
977 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  27.07 
 
 
977 aa  211  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.46 
 
 
989 aa  211  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.39 
 
 
974 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  51.32 
 
 
260 aa  206  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  24.68 
 
 
1059 aa  205  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  32.01 
 
 
546 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  23.09 
 
 
990 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.49 
 
 
994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  25.63 
 
 
999 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  25.63 
 
 
999 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  25.63 
 
 
999 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  25.63 
 
 
999 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  29.55 
 
 
916 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  25.42 
 
 
1020 aa  197  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  26.23 
 
 
977 aa  191  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 
1006 aa  191  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>