187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1095 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  100 
 
 
332 aa  690    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  68.28 
 
 
974 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  63.25 
 
 
969 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  65.55 
 
 
950 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  64.22 
 
 
988 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  62.5 
 
 
969 aa  437  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5222  transposase Tn3 family protein  58.1 
 
 
412 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  55.59 
 
 
815 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  48.3 
 
 
1009 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  61.54 
 
 
874 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  31.37 
 
 
990 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4148  TnpA family transposase  60.8 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160216  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.38 
 
 
986 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  30.65 
 
 
995 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  29.55 
 
 
995 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  28.35 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  29.36 
 
 
990 aa  151  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  29.93 
 
 
983 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  29.41 
 
 
993 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  29.41 
 
 
993 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  28 
 
 
1007 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  28 
 
 
1007 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  29.1 
 
 
994 aa  143  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  29.43 
 
 
989 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  28.88 
 
 
1004 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  28.88 
 
 
1004 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  28.88 
 
 
1004 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  26.73 
 
 
371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  28.93 
 
 
988 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  28.93 
 
 
988 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  28.93 
 
 
988 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  26.17 
 
 
987 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  26.21 
 
 
1012 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  27.69 
 
 
1059 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  29.48 
 
 
988 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  28.21 
 
 
1006 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 
1028 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  28.21 
 
 
1006 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  26.38 
 
 
1013 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  27.27 
 
 
988 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  27.27 
 
 
988 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 
1015 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  26.36 
 
 
989 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 
988 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  26.52 
 
 
999 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  26.52 
 
 
999 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.67 
 
 
988 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  26.52 
 
 
999 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  27.05 
 
 
988 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  26.52 
 
 
999 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 
988 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 
988 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 
988 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.97 
 
 
606 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.41 
 
 
550 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.97 
 
 
988 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  27.41 
 
 
862 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  26.67 
 
 
988 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  26.67 
 
 
988 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  26.67 
 
 
988 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  26.67 
 
 
988 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  27.41 
 
 
994 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  27.41 
 
 
994 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  26.06 
 
 
989 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 
964 aa  129  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26.44 
 
 
988 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 
994 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  27.42 
 
 
988 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  29.61 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  29.61 
 
 
246 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.03 
 
 
1006 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  27.42 
 
 
988 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.53 
 
 
755 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.14 
 
 
990 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.14 
 
 
990 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 
305 aa  126  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 
996 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 
996 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  30.46 
 
 
996 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
990 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
990 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
990 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5123  transposase  65.17 
 
 
89 aa  125  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  27.46 
 
 
1019 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
990 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 
988 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  30.13 
 
 
996 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
990 aa  124  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  31.32 
 
 
992 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  31.32 
 
 
992 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  28.62 
 
 
976 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  28.62 
 
 
924 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.97 
 
 
991 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.97 
 
 
991 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2369  hypothetical protein  53.51 
 
 
240 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.47892 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  26.33 
 
 
985 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  25.66 
 
 
310 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  27.68 
 
 
997 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  28.23 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  26.23 
 
 
546 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>