199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_A0150 on replicon NC_010488
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  100 
 
 		 310 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  99.3 
 
 		 988 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  98.95 
 
 		 988 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  99.3 
 
 		 606 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  94.77 
 
 		 988 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  94.77 
 
 		 988 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  99.61 
 
 		 255 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  86.41 
 
 		 988 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  86.41 
 
 		 988 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  86.41 
 
 		 988 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  86.41 
 
 		 988 aa  512  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  86.41 
 
 		 964 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  86.41 
 
 		 988 aa  508  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  85.71 
 
 		 988 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  86.88 
 
 		 988 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  85.71 
 
 		 988 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  85.02 
 
 		 988 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  86.17 
 
 		 988 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  86.17 
 
 		 988 aa  501  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  84.45 
 
 		 990 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  84.45 
 
 		 990 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  83.33 
 
 		 989 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  84.1 
 
 		 755 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 990 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 990 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 990 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  84.1 
 
 		 990 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  83.75 
 
 		 990 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  80.21 
 
 		 985 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  81.14 
 
 		 989 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  79.43 
 
 		 1015 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  73.87 
 
 		 988 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  73.87 
 
 		 988 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  73.87 
 
 		 988 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  76.57 
 
 		 305 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  99 
 
 		 203 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  67.73 
 
 		 994 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  67.73 
 
 		 550 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  67.73 
 
 		 994 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  67.73 
 
 		 862 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  66.31 
 
 		 994 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  53.29 
 
 		 992 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  54.8 
 
 		 992 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  54.8 
 
 		 992 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  57.54 
 
 		 996 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  57.19 
 
 		 996 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  57.19 
 
 		 996 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  57.19 
 
 		 996 aa  324  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  52.5 
 
 		 987 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  50 
 
 		 338 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  51.4 
 
 		 988 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  51.4 
 
 		 988 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  52.5 
 
 		 983 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  51.07 
 
 		 371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  52.8 
 
 		 991 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  52.8 
 
 		 991 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  51.4 
 
 		 991 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  51.93 
 
 		 999 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  50.89 
 
 		 988 aa  296  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  87.43 
 
 		 339 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  53.96 
 
 		 961 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  53.96 
 
 		 546 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.42 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  86.83 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.42 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  48.1 
 
 		 573 aa  273  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.18 
 
 		 161 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  65.2 
 
 		 224 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  48.87 
 
 		 772 aa  262  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  48.4 
 
 		 983 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  46.61 
 
 		 217 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  55.17 
 
 		 179 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  38.49 
 
 		 771 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  52.33 
 
 		 877 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  39.37 
 
 		 1006 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  40.21 
 
 		 997 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  41.73 
 
 		 924 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  37.63 
 
 		 435 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  41.73 
 
 		 976 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  71.55 
 
 		 126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  71.55 
 
 		 126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  71.55 
 
 		 126 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  36.23 
 
 		 989 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  37.72 
 
 		 1029 aa  175  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  34.53 
 
 		 986 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  34.73 
 
 		 990 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  35.27 
 
 		 994 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  35.41 
 
 		 993 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  35.41 
 
 		 993 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  36.58 
 
 		 990 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  35.56 
 
 		 991 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  35.56 
 
 		 991 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  33.9 
 
 		 1019 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 		 999 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 		 999 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 		 999 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  33.81 
 
 		 999 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  32.65 
 
 		 1059 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  29.77 
 
 		 995 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  35.94 
 
 		 838 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>