201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1822 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
371 aa  771    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  67.12 
 
 
983 aa  548  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  67.12 
 
 
987 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  68.64 
 
 
338 aa  508  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  49.32 
 
 
988 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  49.32 
 
 
988 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  49.59 
 
 
988 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  49.59 
 
 
988 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  49.59 
 
 
606 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  49.46 
 
 
988 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  49.46 
 
 
988 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  49.06 
 
 
755 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  49.46 
 
 
988 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  49.46 
 
 
988 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  49.46 
 
 
964 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  49.06 
 
 
990 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  49.06 
 
 
990 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  49.06 
 
 
990 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  49.06 
 
 
990 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  48.91 
 
 
988 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  49.46 
 
 
988 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  49.46 
 
 
988 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  49.18 
 
 
988 aa  372  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  48.37 
 
 
988 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  48.37 
 
 
988 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  47.45 
 
 
1015 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  48.53 
 
 
990 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  49.59 
 
 
989 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  48.79 
 
 
990 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  48.53 
 
 
990 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  48.91 
 
 
988 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  48.24 
 
 
989 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  49.01 
 
 
985 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  46.74 
 
 
992 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  66.39 
 
 
246 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  65.98 
 
 
246 aa  350  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  47.01 
 
 
988 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  47.01 
 
 
988 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  47.01 
 
 
988 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  48.24 
 
 
862 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  48.24 
 
 
994 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  48.24 
 
 
550 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  48.24 
 
 
994 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  47.04 
 
 
994 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  41.22 
 
 
996 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  41.4 
 
 
996 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  41.4 
 
 
996 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  41.4 
 
 
996 aa  308  8e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  50.7 
 
 
305 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  51.07 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  40.43 
 
 
988 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  39.78 
 
 
988 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  39.78 
 
 
988 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  61.86 
 
 
217 aa  291  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  53.39 
 
 
255 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  41.03 
 
 
992 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  41.03 
 
 
992 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  39.22 
 
 
546 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  37.84 
 
 
991 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  37.84 
 
 
991 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  39.22 
 
 
961 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.12 
 
 
999 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  37.99 
 
 
991 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  40 
 
 
976 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  39.52 
 
 
997 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  40 
 
 
924 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  34.95 
 
 
983 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.29 
 
 
771 aa  243  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  37.14 
 
 
1006 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.04 
 
 
435 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  36.39 
 
 
772 aa  236  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  35.57 
 
 
573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  37.58 
 
 
1029 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 
991 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 
991 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  37.35 
 
 
968 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  50.26 
 
 
203 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  33.97 
 
 
1028 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  34.16 
 
 
1019 aa  200  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  33.24 
 
 
1075 aa  193  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  39.22 
 
 
877 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  31.83 
 
 
989 aa  193  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  45.83 
 
 
224 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  31.59 
 
 
977 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  31.05 
 
 
989 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  47.32 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  30.3 
 
 
1015 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  50.59 
 
 
264 aa  176  9e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1970  TnpA family transposase  33.33 
 
 
1020 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  34.67 
 
 
838 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  30.2 
 
 
995 aa  173  5e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  29.97 
 
 
993 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  29.97 
 
 
993 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  29.91 
 
 
995 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 
990 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  30.87 
 
 
1018 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  31.37 
 
 
1019 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  49.69 
 
 
161 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  48.85 
 
 
273 aa  169  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  29.26 
 
 
994 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>