220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1105 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  45.66 
 
 
988 aa  858    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  45.66 
 
 
988 aa  858    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  45.14 
 
 
989 aa  855    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  38.12 
 
 
983 aa  675    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
996 aa  1994    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  41.21 
 
 
992 aa  851    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  45.75 
 
 
988 aa  854    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  47.43 
 
 
988 aa  899    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  47.02 
 
 
990 aa  893    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  44.36 
 
 
985 aa  844    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  46.88 
 
 
988 aa  885    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  40.48 
 
 
988 aa  654    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  41.24 
 
 
988 aa  724    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  47.07 
 
 
988 aa  896    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  46.52 
 
 
989 aa  882    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  47.93 
 
 
992 aa  800    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  40.02 
 
 
999 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  50.13 
 
 
755 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  47.07 
 
 
988 aa  896    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  47.07 
 
 
988 aa  896    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  40.51 
 
 
991 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  40.51 
 
 
991 aa  674    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  46.46 
 
 
988 aa  881    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  45.55 
 
 
988 aa  850    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
996 aa  1994    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  43.27 
 
 
988 aa  772    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  43.27 
 
 
988 aa  772    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  43.27 
 
 
988 aa  772    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  46.26 
 
 
964 aa  879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  46.82 
 
 
990 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  46.82 
 
 
990 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  46.82 
 
 
990 aa  890    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  45.45 
 
 
988 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  47.07 
 
 
988 aa  896    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  45.45 
 
 
988 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  46.72 
 
 
990 aa  885    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
996 aa  1994    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  97.29 
 
 
996 aa  1937    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  46.73 
 
 
1015 aa  885    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  46.87 
 
 
988 aa  893    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  41.82 
 
 
994 aa  752    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  39.68 
 
 
991 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  40.48 
 
 
988 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  46.57 
 
 
988 aa  882    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  47.93 
 
 
992 aa  800    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  46.82 
 
 
990 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  41.59 
 
 
994 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  41.59 
 
 
994 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  43.09 
 
 
862 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  46.82 
 
 
990 aa  889    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  39.26 
 
 
961 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.31 
 
 
987 aa  624  1e-177  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  39.05 
 
 
983 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  50.6 
 
 
606 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  39.82 
 
 
877 aa  582  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  40.17 
 
 
731 aa  551  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  49.82 
 
 
550 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  37.83 
 
 
772 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  47.95 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  43.33 
 
 
526 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  44.18 
 
 
573 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  32.13 
 
 
738 aa  379  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.57 
 
 
1006 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  31.02 
 
 
976 aa  334  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.58 
 
 
997 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  54.13 
 
 
305 aa  332  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  32.56 
 
 
613 aa  331  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  30.93 
 
 
968 aa  330  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  31.56 
 
 
924 aa  327  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  57.19 
 
 
310 aa  325  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  31.28 
 
 
612 aa  321  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  33.47 
 
 
523 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  41.4 
 
 
371 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.35 
 
 
1029 aa  307  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 
991 aa  302  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 
991 aa  302  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  43.16 
 
 
338 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  57.87 
 
 
255 aa  288  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  28.33 
 
 
1028 aa  261  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  27.88 
 
 
1075 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  47.43 
 
 
273 aa  259  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  60.31 
 
 
203 aa  238  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
1026 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  30.89 
 
 
1026 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  25.73 
 
 
989 aa  235  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  29.86 
 
 
771 aa  234  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  30.76 
 
 
1028 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  30.76 
 
 
1028 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  45.96 
 
 
246 aa  231  6e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  45.53 
 
 
246 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  28.76 
 
 
1015 aa  227  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.03 
 
 
993 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 
993 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.8 
 
 
990 aa  223  1.9999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  56.92 
 
 
224 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.27 
 
 
994 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  32.86 
 
 
435 aa  219  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  31.51 
 
 
440 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  29.08 
 
 
929 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  23.2 
 
 
995 aa  209  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>