202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3065 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  86.21 
 
 
1004 aa  1786    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  48.06 
 
 
986 aa  955    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  100 
 
 
1004 aa  2081    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  57.59 
 
 
1059 aa  1190    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  59.25 
 
 
999 aa  1241    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  64.93 
 
 
1007 aa  1343    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  59.25 
 
 
999 aa  1241    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  54.21 
 
 
1013 aa  1102    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  64.93 
 
 
1007 aa  1343    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  100 
 
 
1004 aa  2081    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  55.38 
 
 
1012 aa  1134    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  59.25 
 
 
999 aa  1241    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  39.14 
 
 
1028 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  59.25 
 
 
999 aa  1241    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  45.67 
 
 
990 aa  905    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
1006 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  38.13 
 
 
1006 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  36.36 
 
 
990 aa  626  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  34.07 
 
 
995 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  35.74 
 
 
989 aa  604  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  33.77 
 
 
995 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  35.69 
 
 
993 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  35.69 
 
 
993 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  35.01 
 
 
994 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  26.14 
 
 
969 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.62 
 
 
988 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.62 
 
 
988 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 
988 aa  268  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 
988 aa  268  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  24.98 
 
 
988 aa  267  8.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  25.53 
 
 
988 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  25.23 
 
 
988 aa  262  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  25.1 
 
 
988 aa  258  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  24.5 
 
 
950 aa  258  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.1 
 
 
990 aa  258  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.1 
 
 
990 aa  258  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.21 
 
 
988 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  24.85 
 
 
989 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  24.1 
 
 
988 aa  255  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  24.1 
 
 
988 aa  255  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  24.1 
 
 
988 aa  255  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.53 
 
 
988 aa  255  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  24.1 
 
 
988 aa  255  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.59 
 
 
988 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.49 
 
 
1015 aa  254  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  24.75 
 
 
989 aa  253  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.26 
 
 
990 aa  252  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
990 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
990 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
990 aa  252  3e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 
964 aa  251  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.12 
 
 
983 aa  251  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 
990 aa  251  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.39 
 
 
985 aa  243  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.18 
 
 
992 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.16 
 
 
987 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.19 
 
 
974 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 
994 aa  223  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  28.62 
 
 
536 aa  220  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.01 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.01 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.01 
 
 
988 aa  220  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  24.06 
 
 
994 aa  220  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  24.06 
 
 
994 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.37 
 
 
961 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.8 
 
 
755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.38 
 
 
862 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  28.33 
 
 
606 aa  214  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
969 aa  208  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  37.28 
 
 
335 aa  206  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.73 
 
 
771 aa  202  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  22.88 
 
 
988 aa  201  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  24.42 
 
 
877 aa  200  9e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  24.56 
 
 
988 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.12 
 
 
1006 aa  194  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.66 
 
 
976 aa  194  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.39 
 
 
997 aa  194  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.66 
 
 
924 aa  194  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.53 
 
 
550 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.54 
 
 
988 aa  190  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 
996 aa  189  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.35 
 
 
988 aa  188  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.8 
 
 
996 aa  188  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.8 
 
 
996 aa  188  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.8 
 
 
996 aa  188  5e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  23.98 
 
 
815 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3614  transposase Tn3 family protein  23.75 
 
 
1009 aa  186  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.86 
 
 
983 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.05 
 
 
991 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.05 
 
 
991 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 
968 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.62 
 
 
991 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  23.52 
 
 
992 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  23.52 
 
 
992 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  50 
 
 
212 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  22.92 
 
 
999 aa  163  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  22.63 
 
 
991 aa  162  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  22.63 
 
 
991 aa  162  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  22.21 
 
 
738 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  25.67 
 
 
546 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>