66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5145 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  100 
 
 		 335 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  65.14 
 
 		 1013 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  53.52 
 
 		 1012 aa  326  3e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  43.56 
 
 		 999 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  43.56 
 
 		 999 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  43.56 
 
 		 999 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  43.56 
 
 		 999 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  43.73 
 
 		 1059 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  40.24 
 
 		 1004 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  39.02 
 
 		 1007 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  39.02 
 
 		 1007 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  37.28 
 
 		 1004 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  37.28 
 
 		 1004 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  36.75 
 
 		 986 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  31.1 
 
 		 990 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  32.42 
 
 		 1028 aa  155  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  28.44 
 
 		 1006 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  28.44 
 
 		 1006 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  27.66 
 
 		 536 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  27.16 
 
 		 990 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 		 994 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  27.71 
 
 		 989 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  26.43 
 
 		 995 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.93 
 
 		 993 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.93 
 
 		 993 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 		 995 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6380  Tn5044 transposase  26.45 
 
 		 254 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  22.47 
 
 		 738 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.73 
 
 		 1006 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  22.87 
 
 		 992 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  22.87 
 
 		 992 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  21.96 
 
 		 988 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  21.96 
 
 		 988 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.67 
 
 		 988 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  20.63 
 
 		 983 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0023  hypothetical protein  33.75 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0873848  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.27 
 
 		 988 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  22.3 
 
 		 988 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.27 
 
 		 988 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  23.69 
 
 		 999 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.88 
 
 		 991 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.88 
 
 		 991 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  23.71 
 
 		 996 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.38 
 
 		 988 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  23.6 
 
 		 523 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  23.6 
 
 		 613 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.3 
 
 		 988 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.27 
 
 		 988 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 		 996 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 		 996 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 		 996 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 		 990 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 		 526 aa  44.3  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.27 
 
 		 988 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 		 990 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 		 990 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 		 990 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.24 
 
 		 991 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  20.13 
 
 		 987 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  21.89 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 440 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 994 aa  43.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 994 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  21.89 
 
 		 961 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  21.54 
 
 		 612 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  25.52 
 
 		 989 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>