226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5425 on replicon NC_010727
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  42.48 
 
 		 988 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  42.48 
 
 		 988 aa  816    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  43.04 
 
 		 989 aa  813    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  47.93 
 
 		 996 aa  845    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  40.21 
 
 		 961 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  43.03 
 
 		 988 aa  792    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  36.88 
 
 		 983 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  37.31 
 
 		 992 aa  749    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  47.93 
 
 		 996 aa  845    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  41.56 
 
 		 983 aa  670    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  43.97 
 
 		 988 aa  827    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  43.52 
 
 		 990 aa  814    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  43.42 
 
 		 990 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  43.98 
 
 		 988 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  43.84 
 
 		 989 aa  825    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  43.98 
 
 		 988 aa  831    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  44.28 
 
 		 988 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  44.53 
 
 		 755 aa  657    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  43.98 
 
 		 988 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  43.98 
 
 		 988 aa  834    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  47.93 
 
 		 996 aa  848    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  38.65 
 
 		 991 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  38.65 
 
 		 991 aa  656    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  42.73 
 
 		 988 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  44.62 
 
 		 988 aa  839    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  47.93 
 
 		 996 aa  845    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  100 
 
 		 992 aa  1980    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  42.37 
 
 		 988 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  42.37 
 
 		 988 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  42.37 
 
 		 988 aa  753    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  43.77 
 
 		 964 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  43.22 
 
 		 990 aa  807    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  43.22 
 
 		 990 aa  807    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  43.22 
 
 		 990 aa  807    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  42.72 
 
 		 988 aa  789    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 992 aa  1980    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  42.72 
 
 		 988 aa  789    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  43.03 
 
 		 990 aa  805    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  43.14 
 
 		 988 aa  793    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  41.77 
 
 		 994 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  43.98 
 
 		 988 aa  834    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  43.45 
 
 		 988 aa  806    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  43.03 
 
 		 1015 aa  809    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  42.11 
 
 		 985 aa  795    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  37.18 
 
 		 987 aa  659    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  40.99 
 
 		 994 aa  742    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  40.99 
 
 		 994 aa  743    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  41.33 
 
 		 862 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  43.42 
 
 		 990 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  37.36 
 
 		 991 aa  624  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  37.16 
 
 		 999 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  39.45 
 
 		 988 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  39.35 
 
 		 988 aa  611  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  48.7 
 
 		 606 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  37.93 
 
 		 877 aa  547  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  47.31 
 
 		 550 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 772 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  35.63 
 
 		 731 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  45.44 
 
 		 546 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  40.77 
 
 		 573 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  31.84 
 
 		 738 aa  364  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.77 
 
 		 1006 aa  363  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  32.46 
 
 		 976 aa  353  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  30.83 
 
 		 968 aa  352  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  37.26 
 
 		 526 aa  341  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.02 
 
 		 924 aa  335  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  54.3 
 
 		 305 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  54.8 
 
 		 310 aa  329  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  29.42 
 
 		 997 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  40.92 
 
 		 371 aa  301  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  56.8 
 
 		 255 aa  297  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  30.38 
 
 		 612 aa  297  8e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  43.49 
 
 		 338 aa  293  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  28.28 
 
 		 991 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  28.28 
 
 		 991 aa  291  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  31.08 
 
 		 613 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.67 
 
 		 989 aa  259  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  33.48 
 
 		 440 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  30.62 
 
 		 523 aa  253  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  26.46 
 
 		 1029 aa  249  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  28.13 
 
 		 1028 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  26.3 
 
 		 990 aa  242  2.9999999999999997e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  37.09 
 
 		 400 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  27.96 
 
 		 1075 aa  239  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  30.34 
 
 		 771 aa  239  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  25.73 
 
 		 993 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  25.73 
 
 		 993 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  45.11 
 
 		 273 aa  235  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  34.28 
 
 		 435 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  46.53 
 
 		 246 aa  230  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  26.61 
 
 		 994 aa  230  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  26.41 
 
 		 950 aa  230  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  46.53 
 
 		 246 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  27.18 
 
 		 1059 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  56.19 
 
 		 203 aa  227  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  23.62 
 
 		 990 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  24.13 
 
 		 995 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  37.25 
 
 		 358 aa  221  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  23.91 
 
 		 995 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.79 
 
 		 969 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>