219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2705 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  49.05 
 
 
1006 aa  901    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  45.09 
 
 
1028 aa  758    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  46.05 
 
 
1029 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  41.92 
 
 
1075 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
991 aa  2006    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
991 aa  2006    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  64.79 
 
 
997 aa  1288    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  52.06 
 
 
771 aa  593  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  43.06 
 
 
916 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  55.4 
 
 
435 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.74 
 
 
987 aa  423  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  29.56 
 
 
983 aa  419  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.35 
 
 
992 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.64 
 
 
988 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.64 
 
 
988 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.84 
 
 
988 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 
988 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  29.46 
 
 
990 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  29.46 
 
 
990 aa  376  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  29.02 
 
 
988 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  29.02 
 
 
988 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.48 
 
 
988 aa  369  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  29.36 
 
 
990 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.3 
 
 
990 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.3 
 
 
990 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.3 
 
 
990 aa  366  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.22 
 
 
988 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.3 
 
 
990 aa  366  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  29.32 
 
 
1015 aa  363  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  28.61 
 
 
988 aa  360  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  28.61 
 
 
988 aa  360  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  28.61 
 
 
988 aa  360  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  28.61 
 
 
988 aa  360  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  28.76 
 
 
989 aa  359  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  28.87 
 
 
988 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  28.63 
 
 
988 aa  358  3.9999999999999996e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  29.32 
 
 
964 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  28.76 
 
 
988 aa  357  8.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 
988 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 
988 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 
988 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  28.33 
 
 
989 aa  346  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  28.56 
 
 
994 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 
985 aa  323  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  28.56 
 
 
994 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  29.71 
 
 
976 aa  313  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  29.42 
 
 
996 aa  309  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 
996 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 
996 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  29.52 
 
 
996 aa  308  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  50.79 
 
 
838 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 
862 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  27.98 
 
 
994 aa  300  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  29.42 
 
 
924 aa  298  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  29.14 
 
 
988 aa  297  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.48 
 
 
968 aa  295  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  29.87 
 
 
755 aa  296  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  29.04 
 
 
988 aa  295  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  27.87 
 
 
961 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  26.12 
 
 
988 aa  287  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.38 
 
 
992 aa  281  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 
992 aa  281  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  26.87 
 
 
991 aa  268  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  26.87 
 
 
991 aa  268  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  32.72 
 
 
606 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  50.68 
 
 
492 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.29 
 
 
991 aa  259  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  26.92 
 
 
983 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.34 
 
 
999 aa  249  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  27.95 
 
 
877 aa  244  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  31.81 
 
 
550 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  22.71 
 
 
990 aa  235  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  24.85 
 
 
986 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  37.01 
 
 
338 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  25.53 
 
 
738 aa  227  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  22.1 
 
 
995 aa  226  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 
371 aa  226  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  23.48 
 
 
990 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  24.23 
 
 
989 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  23.71 
 
 
993 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  23.71 
 
 
993 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  26.14 
 
 
988 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.4 
 
 
974 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.25 
 
 
969 aa  215  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  21.46 
 
 
995 aa  209  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  26.01 
 
 
612 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
969 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
731 aa  202  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24 
 
 
994 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  30.29 
 
 
546 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  24.82 
 
 
950 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  28.57 
 
 
573 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  23.22 
 
 
1059 aa  190  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  25 
 
 
979 aa  189  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  22.56 
 
 
1006 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  22.56 
 
 
1006 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  22.94 
 
 
1018 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  25.72 
 
 
979 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  21.24 
 
 
999 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  21.24 
 
 
999 aa  183  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>