222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  51.05 
 
 		 916 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  42.27 
 
 		 1006 aa  742    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  48.1 
 
 		 1075 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  45.19 
 
 		 991 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  45.19 
 
 		 991 aa  771    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  42.83 
 
 		 997 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  100 
 
 		 1028 aa  2058    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  35.24 
 
 		 1029 aa  552  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  45.45 
 
 		 771 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  48.48 
 
 		 435 aa  403  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  57.76 
 
 		 838 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  29.13 
 
 		 983 aa  373  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  28.68 
 
 		 987 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  30.57 
 
 		 988 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  30.57 
 
 		 988 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  30.77 
 
 		 988 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  30.57 
 
 		 988 aa  358  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  30.34 
 
 		 988 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  30.34 
 
 		 988 aa  352  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  29.54 
 
 		 988 aa  349  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.8 
 
 		 988 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.8 
 
 		 988 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.8 
 
 		 988 aa  348  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.8 
 
 		 988 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  29.53 
 
 		 988 aa  343  8e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  29.63 
 
 		 988 aa  341  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  29.64 
 
 		 989 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  29.46 
 
 		 988 aa  340  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.48 
 
 		 988 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  29.7 
 
 		 990 aa  334  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  29.29 
 
 		 990 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  29.66 
 
 		 964 aa  332  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  29.84 
 
 		 990 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  29.84 
 
 		 990 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  29.84 
 
 		 990 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  29.29 
 
 		 990 aa  332  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  28.54 
 
 		 994 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  28.54 
 
 		 994 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  31.14 
 
 		 988 aa  330  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  31.14 
 
 		 988 aa  330  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  31.14 
 
 		 988 aa  330  7e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  29.74 
 
 		 990 aa  328  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  28.5 
 
 		 989 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  25.81 
 
 		 992 aa  324  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  28.22 
 
 		 1015 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  28.91 
 
 		 994 aa  318  2e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  28.13 
 
 		 985 aa  304  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  28.56 
 
 		 862 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.66 
 
 		 968 aa  296  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.32 
 
 		 991 aa  290  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.32 
 
 		 991 aa  290  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  30.29 
 
 		 976 aa  287  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  30.87 
 
 		 924 aa  282  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  28.59 
 
 		 996 aa  281  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  28.6 
 
 		 996 aa  278  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  28.6 
 
 		 996 aa  278  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  28.6 
 
 		 996 aa  278  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  30.35 
 
 		 988 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  30.17 
 
 		 988 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  28.34 
 
 		 983 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.02 
 
 		 999 aa  268  4e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  26.17 
 
 		 991 aa  265  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  30.23 
 
 		 755 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  27.21 
 
 		 961 aa  258  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.62 
 
 		 988 aa  250  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  31.99 
 
 		 606 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  28.42 
 
 		 992 aa  240  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  28.42 
 
 		 992 aa  240  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  31.26 
 
 		 550 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  27.21 
 
 		 877 aa  211  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.27 
 
 		 990 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  33.97 
 
 		 371 aa  205  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  34.33 
 
 		 338 aa  201  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 994 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  26.15 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  22.61 
 
 		 990 aa  197  9e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  24.83 
 
 		 738 aa  194  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  20.51 
 
 		 995 aa  193  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  26.54 
 
 		 612 aa  191  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  24.23 
 
 		 993 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  24.23 
 
 		 993 aa  190  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  23.85 
 
 		 1028 aa  189  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  22.66 
 
 		 999 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  22.66 
 
 		 999 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  22.66 
 
 		 999 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  22.66 
 
 		 999 aa  184  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  25.91 
 
 		 989 aa  182  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  22.51 
 
 		 986 aa  182  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  23.02 
 
 		 1059 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.14 
 
 		 546 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  19.88 
 
 		 995 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  40.54 
 
 		 492 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  22.61 
 
 		 1013 aa  169  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.65 
 
 		 772 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  22.57 
 
 		 1007 aa  164  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  22.57 
 
 		 1007 aa  164  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  23.85 
 
 		 1012 aa  163  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  23.41 
 
 		 988 aa  161  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.7 
 
 		 974 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  33.79 
 
 		 305 aa  158  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>