175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1821 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  51.66 
 
 
983 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
612 aa  1236    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  50.66 
 
 
738 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  47.44 
 
 
987 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  51.25 
 
 
523 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  51.25 
 
 
613 aa  489  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  37.13 
 
 
992 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  36.14 
 
 
1015 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  34.54 
 
 
731 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  34.79 
 
 
990 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  35.69 
 
 
988 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  35.69 
 
 
988 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  35.69 
 
 
988 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  34.79 
 
 
990 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  35.52 
 
 
988 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  34.62 
 
 
990 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
990 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
990 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
990 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
990 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  34.06 
 
 
985 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  34.29 
 
 
988 aa  378  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  33.22 
 
 
988 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  33.22 
 
 
988 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  33.22 
 
 
988 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  33.22 
 
 
988 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  33.28 
 
 
988 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  33.56 
 
 
988 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  33.56 
 
 
989 aa  369  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  33.67 
 
 
988 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  33.45 
 
 
988 aa  364  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  34.36 
 
 
988 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  34.36 
 
 
988 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  33.84 
 
 
989 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  32.83 
 
 
964 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  33.94 
 
 
994 aa  333  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  35.26 
 
 
526 aa  333  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
994 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  32.95 
 
 
994 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 
988 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 
988 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  31.58 
 
 
988 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  31.45 
 
 
996 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  31.28 
 
 
996 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  31.28 
 
 
996 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  31.28 
 
 
996 aa  307  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  31.31 
 
 
988 aa  280  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  31.31 
 
 
988 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  30.38 
 
 
992 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  30.38 
 
 
992 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  33.06 
 
 
862 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  28.22 
 
 
877 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  36.24 
 
 
755 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  28.23 
 
 
988 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  27.42 
 
 
961 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.38 
 
 
991 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27 
 
 
991 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27 
 
 
991 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  27.84 
 
 
999 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  25.37 
 
 
983 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  31.08 
 
 
440 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.62 
 
 
968 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  26.76 
 
 
997 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  26.01 
 
 
991 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  26.01 
 
 
991 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.32 
 
 
1006 aa  183  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
976 aa  176  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.36 
 
 
1028 aa  174  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  23.85 
 
 
916 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
924 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  28.35 
 
 
400 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  25.77 
 
 
1075 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  24.77 
 
 
423 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  40.1 
 
 
606 aa  150  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  26.32 
 
 
358 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  22.04 
 
 
1029 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  22.86 
 
 
772 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  22.59 
 
 
986 aa  126  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4930  transposase Tn3 family protein  27.38 
 
 
492 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142055  normal  0.882247 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  21.17 
 
 
1059 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  20.46 
 
 
990 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  38.12 
 
 
550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  20.29 
 
 
1007 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  20.29 
 
 
1007 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  21.31 
 
 
969 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  23.73 
 
 
570 aa  107  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  23 
 
 
969 aa  107  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
974 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  21.16 
 
 
1004 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  21.16 
 
 
1004 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  20.83 
 
 
1004 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  21.43 
 
 
999 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  21.43 
 
 
999 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  21.43 
 
 
999 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  21.43 
 
 
999 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  23.85 
 
 
950 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 
874 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  22.31 
 
 
972 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  35.88 
 
 
174 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  30.37 
 
 
260 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>