200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_B0072 on replicon NC_011092
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  100 
 
 
961 aa  1020    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  100 
 
 
546 aa  1118    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  68.67 
 
 
772 aa  707    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  69.88 
 
 
573 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  47.21 
 
 
988 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  47.21 
 
 
988 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  47.01 
 
 
1015 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  46.61 
 
 
988 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  46.61 
 
 
988 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  46.61 
 
 
988 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  46.61 
 
 
988 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  45.62 
 
 
988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  45.62 
 
 
988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  46.61 
 
 
988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  46.22 
 
 
988 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  46.41 
 
 
988 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  46.02 
 
 
985 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  46.22 
 
 
964 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  46.02 
 
 
988 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  46.02 
 
 
988 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  46.61 
 
 
606 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  46.22 
 
 
988 aa  445  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  46.02 
 
 
988 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  46.63 
 
 
755 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  46.23 
 
 
988 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  46.23 
 
 
988 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  46.23 
 
 
988 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  46.63 
 
 
990 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  46.63 
 
 
990 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  46.63 
 
 
990 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  48.14 
 
 
996 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  45.83 
 
 
990 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  46.63 
 
 
990 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  46.63 
 
 
990 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  45.83 
 
 
990 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  45.33 
 
 
989 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  44.53 
 
 
989 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  47.95 
 
 
996 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  47.95 
 
 
996 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  47.95 
 
 
996 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  44.73 
 
 
994 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  44.73 
 
 
550 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  44.73 
 
 
994 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  44.73 
 
 
862 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  43.74 
 
 
994 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  39.04 
 
 
992 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  43.37 
 
 
988 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  42.97 
 
 
988 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  42.97 
 
 
988 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  42 
 
 
991 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  41.4 
 
 
999 aa  398  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  42.77 
 
 
991 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  42.77 
 
 
991 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  45.44 
 
 
992 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  45.44 
 
 
992 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  40.2 
 
 
983 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  40.4 
 
 
983 aa  356  5e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  37.33 
 
 
987 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  42.39 
 
 
877 aa  326  7e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  53.12 
 
 
305 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  53.96 
 
 
310 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  41.8 
 
 
338 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  39.22 
 
 
371 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  54.89 
 
 
255 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  32.18 
 
 
771 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  46.64 
 
 
246 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  32.13 
 
 
435 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  46.19 
 
 
246 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  30.16 
 
 
1006 aa  216  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  33 
 
 
997 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  42.21 
 
 
273 aa  210  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  31.39 
 
 
976 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  31.39 
 
 
924 aa  207  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.01 
 
 
968 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  30.29 
 
 
991 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  30.29 
 
 
991 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  56.07 
 
 
203 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  30.5 
 
 
1028 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  30.5 
 
 
1028 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  55.75 
 
 
224 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  30.56 
 
 
990 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  30.5 
 
 
1026 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  30.5 
 
 
1026 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.42 
 
 
1029 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  43.28 
 
 
217 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  27.59 
 
 
1018 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  28.85 
 
 
990 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  74.77 
 
 
112 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1962  transposase Tn3 family protein  31.28 
 
 
929 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  28.14 
 
 
1028 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  28.95 
 
 
989 aa  177  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  56.58 
 
 
339 aa  176  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 
1006 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 
1006 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0215  transposase  27.04 
 
 
1015 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.20757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  27.09 
 
 
989 aa  176  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.17 
 
 
986 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  28.77 
 
 
993 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  28.77 
 
 
993 aa  173  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  57.34 
 
 
264 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>