216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2998 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  87.68 
 
 		 988 aa  1368    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  82.78 
 
 		 988 aa  1303    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  82.78 
 
 		 988 aa  1303    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  85.17 
 
 		 989 aa  1339    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  50.53 
 
 		 996 aa  758    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  47.2 
 
 		 992 aa  788    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  75.8 
 
 		 988 aa  1165    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  89.4 
 
 		 988 aa  1389    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  88.08 
 
 		 988 aa  1373    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  88.08 
 
 		 988 aa  1373    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  89.54 
 
 		 989 aa  1399    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  99.47 
 
 		 990 aa  1543    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  100 
 
 		 755 aa  1551    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  88.08 
 
 		 988 aa  1373    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  88.08 
 
 		 988 aa  1373    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  76.34 
 
 		 988 aa  1174    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  50.13 
 
 		 996 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  79.09 
 
 		 985 aa  1227    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  63.18 
 
 		 988 aa  977    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  63.18 
 
 		 988 aa  977    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  63.18 
 
 		 988 aa  977    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  88.61 
 
 		 964 aa  1379    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  88.48 
 
 		 988 aa  1382    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  88.34 
 
 		 988 aa  1379    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  64.57 
 
 		 731 aa  645    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  99.47 
 
 		 990 aa  1543    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  99.47 
 
 		 990 aa  1543    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  99.47 
 
 		 990 aa  1543    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  75.53 
 
 		 988 aa  1167    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  75.53 
 
 		 988 aa  1167    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  99.21 
 
 		 990 aa  1541    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  88.48 
 
 		 988 aa  1376    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  96.56 
 
 		 990 aa  1508    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  74.1 
 
 		 1015 aa  1173    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  78.31 
 
 		 606 aa  950    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  60.05 
 
 		 994 aa  928    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  64.14 
 
 		 550 aa  717    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  60.19 
 
 		 994 aa  930    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  60.19 
 
 		 862 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  50.13 
 
 		 996 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  96.56 
 
 		 990 aa  1508    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  50.13 
 
 		 996 aa  744    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  59.92 
 
 		 994 aa  919    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  43.18 
 
 		 987 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  42.93 
 
 		 988 aa  627  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  41.86 
 
 		 983 aa  619  1e-176  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  44.53 
 
 		 992 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  44.53 
 
 		 992 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  43.89 
 
 		 988 aa  600  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  43.89 
 
 		 988 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  98.21 
 
 		 526 aa  568  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  40.7 
 
 		 999 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  40 
 
 		 991 aa  540  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  40.71 
 
 		 961 aa  537  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  39.87 
 
 		 991 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  39.87 
 
 		 991 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  39.29 
 
 		 772 aa  496  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  84.1 
 
 		 310 aa  492  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  37.4 
 
 		 983 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  39.91 
 
 		 877 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  74.83 
 
 		 305 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  46.63 
 
 		 546 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  84.06 
 
 		 255 aa  432  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  41.34 
 
 		 573 aa  429  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  49.06 
 
 		 371 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  63.67 
 
 		 273 aa  351  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.66 
 
 		 338 aa  344  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  32.5 
 
 		 1006 aa  340  8e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  33.86 
 
 		 924 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  33.86 
 
 		 976 aa  337  5e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  34.44 
 
 		 968 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  93.6 
 
 		 339 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  83.94 
 
 		 203 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  31.45 
 
 		 997 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.23 
 
 		 771 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  91.86 
 
 		 264 aa  313  7.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  35.63 
 
 		 738 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  35.63 
 
 		 613 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  92.55 
 
 		 161 aa  304  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  68.66 
 
 		 224 aa  282  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 		 991 aa  281  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  29.87 
 
 		 991 aa  281  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  52.03 
 
 		 246 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  52.03 
 
 		 246 aa  277  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  38.22 
 
 		 435 aa  276  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  27.87 
 
 		 989 aa  272  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  35.41 
 
 		 523 aa  270  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  30.83 
 
 		 1029 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  27.2 
 
 		 986 aa  260  8e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  36.24 
 
 		 612 aa  258  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.53 
 
 		 990 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  31.87 
 
 		 1028 aa  249  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  26.71 
 
 		 993 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  26.71 
 
 		 993 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  28.33 
 
 		 1075 aa  246  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  27.22 
 
 		 990 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  26.84 
 
 		 1059 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 994 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 999 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 		 999 aa  234  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>