166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3465 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  72.23 
 
 		 988 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  72.23 
 
 		 988 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  78.25 
 
 		 989 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  64.34 
 
 		 1015 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  77.86 
 
 		 988 aa  817    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  64.66 
 
 		 988 aa  667    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  95.73 
 
 		 990 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  85.24 
 
 		 988 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  85.24 
 
 		 989 aa  916    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  85.24 
 
 		 988 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  85.24 
 
 		 988 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 526 aa  1082    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  80.19 
 
 		 988 aa  854    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  80 
 
 		 964 aa  846    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  84.27 
 
 		 988 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  61.36 
 
 		 731 aa  667    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  99.03 
 
 		 990 aa  1050    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  99.03 
 
 		 990 aa  1050    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  99.03 
 
 		 990 aa  1050    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  64.66 
 
 		 988 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  64.66 
 
 		 988 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  98.83 
 
 		 990 aa  1045    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  76.12 
 
 		 985 aa  836    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  84.85 
 
 		 988 aa  909    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  95.73 
 
 		 990 aa  1018    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  85.24 
 
 		 988 aa  914    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  99.42 
 
 		 990 aa  1054    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  85.05 
 
 		 988 aa  916    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  64.85 
 
 		 988 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  98.21 
 
 		 755 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  51.26 
 
 		 988 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  51.26 
 
 		 988 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  51.26 
 
 		 988 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  47.57 
 
 		 994 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  45.63 
 
 		 994 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  45.44 
 
 		 994 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  42.72 
 
 		 996 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  42.72 
 
 		 996 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  42.72 
 
 		 996 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  39 
 
 		 992 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  42.94 
 
 		 996 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  44.06 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  47.26 
 
 		 862 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  37.84 
 
 		 983 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  35.26 
 
 		 612 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.91 
 
 		 987 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  34.43 
 
 		 738 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  37.26 
 
 		 992 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  37.26 
 
 		 992 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  34.17 
 
 		 988 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  32.23 
 
 		 877 aa  280  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  32.93 
 
 		 961 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  36.34 
 
 		 523 aa  263  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  36.34 
 
 		 613 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  34.67 
 
 		 988 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  34.67 
 
 		 988 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  30.99 
 
 		 991 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  30.99 
 
 		 991 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  30.95 
 
 		 991 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  31.45 
 
 		 999 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1051  transposase Tn3  64.12 
 
 		 171 aa  229  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  29.94 
 
 		 983 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4307  hypothetical protein  33 
 
 		 400 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1567  transposase  32.39 
 
 		 358 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.385647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  69.37 
 
 		 606 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  28.37 
 
 		 968 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  30.99 
 
 		 772 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  26.54 
 
 		 1006 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 991 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 991 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  25.27 
 
 		 997 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  27.83 
 
 		 976 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  26.59 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  28.3 
 
 		 924 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.17 
 
 		 974 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3677  hypothetical protein  37.93 
 
 		 174 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.472291 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.02 
 
 		 969 aa  110  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  22.76 
 
 		 1013 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  26.38 
 
 		 916 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  26.16 
 
 		 950 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.38 
 
 		 1028 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4124  transposase Tn3  60.67 
 
 		 102 aa  103  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0632177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  24.25 
 
 		 1075 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  80.33 
 
 		 339 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  76.56 
 
 		 111 aa  100  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  22.47 
 
 		 986 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  24.06 
 
 		 570 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  21.69 
 
 		 1012 aa  94.7  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  22.6 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  22.6 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  22.6 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  22.6 
 
 		 999 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  24.43 
 
 		 1029 aa  92  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  54.29 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.7 
 
 		 969 aa  91.7  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  24.59 
 
 		 990 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2035  transposase Tn3 family protein  23.58 
 
 		 659 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  0.850327 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  22.38 
 
 		 1004 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  22.38 
 
 		 1004 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  21.78 
 
 		 989 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>