53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0916 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  227  5e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  71.23 
 
 
988 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  79.69 
 
 
988 aa  102  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  79.69 
 
 
988 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  79.69 
 
 
988 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  79.69 
 
 
988 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  79.69 
 
 
988 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  79.69 
 
 
988 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  78.12 
 
 
988 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  68.49 
 
 
988 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  68.49 
 
 
964 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
990 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
990 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
990 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
990 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
990 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  76.56 
 
 
526 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  76.56 
 
 
989 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  76.56 
 
 
755 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  75 
 
 
990 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  75 
 
 
990 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  63.51 
 
 
988 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  63.51 
 
 
988 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  71.88 
 
 
989 aa  94  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  65.62 
 
 
1015 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  51.35 
 
 
985 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  59.38 
 
 
988 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  59.38 
 
 
988 aa  76.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  59.38 
 
 
988 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  59.38 
 
 
988 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  48.44 
 
 
731 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  51.56 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  51.56 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  51.56 
 
 
988 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  61.22 
 
 
606 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  42.19 
 
 
994 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  42.19 
 
 
862 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  40.62 
 
 
996 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  40.62 
 
 
996 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  40.62 
 
 
996 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  42.19 
 
 
994 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  40.62 
 
 
996 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  45.31 
 
 
994 aa  54.7  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  35.48 
 
 
987 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  32 
 
 
423 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  32.26 
 
 
738 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  32.26 
 
 
613 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  32.26 
 
 
523 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  33.33 
 
 
992 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  30.16 
 
 
612 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  30.65 
 
 
983 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  29.31 
 
 
968 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  40.82 
 
 
440 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>