114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4142 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4142  putative transposase  100 
 
 		 423 aa  837    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  57.52 
 
 		 968 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  44.61 
 
 		 976 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  45.78 
 
 		 924 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  24.77 
 
 		 612 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6366  transposase  52.76 
 
 		 260 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.714765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.32 
 
 		 983 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  29.5 
 
 		 1006 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  27.39 
 
 		 988 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  27.39 
 
 		 988 aa  143  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  29.38 
 
 		 988 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  24.5 
 
 		 987 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  27.93 
 
 		 988 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  24.2 
 
 		 992 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  27.89 
 
 		 989 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 994 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  26.97 
 
 		 1015 aa  136  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  24.39 
 
 		 994 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  23.62 
 
 		 738 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  27.94 
 
 		 988 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  27.94 
 
 		 988 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  27.94 
 
 		 988 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  27.43 
 
 		 988 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  27.17 
 
 		 989 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 		 994 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.22 
 
 		 988 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  27.15 
 
 		 988 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  27.15 
 
 		 988 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  27.15 
 
 		 988 aa  129  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  27.15 
 
 		 988 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  26.89 
 
 		 988 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  24.94 
 
 		 731 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  27.49 
 
 		 964 aa  124  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  24.21 
 
 		 523 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 988 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 		 990 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 		 990 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 		 990 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.67 
 
 		 990 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  24.21 
 
 		 613 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  26.82 
 
 		 526 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.31 
 
 		 988 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.31 
 
 		 988 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.42 
 
 		 990 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.22 
 
 		 988 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  27.31 
 
 		 990 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  27.31 
 
 		 990 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  31.52 
 
 		 755 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  26.68 
 
 		 985 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  27.4 
 
 		 992 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  27.4 
 
 		 992 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 983 aa  104  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  27.19 
 
 		 996 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  27.19 
 
 		 996 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  27.19 
 
 		 996 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  27.32 
 
 		 996 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.56 
 
 		 862 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  25.24 
 
 		 877 aa  95.5  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  22.66 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.67 
 
 		 988 aa  87  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  25.52 
 
 		 1075 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  26.1 
 
 		 997 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.97 
 
 		 991 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.97 
 
 		 991 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  42.11 
 
 		 606 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 		 974 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  24.34 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.27 
 
 		 991 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  23.87 
 
 		 999 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  21.13 
 
 		 989 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5219  transposase Tn3 family protein  26.18 
 
 		 570 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  23.33 
 
 		 999 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  23.33 
 
 		 999 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  23.33 
 
 		 999 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  23.33 
 
 		 999 aa  66.6  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 		 988 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  26.4 
 
 		 988 aa  66.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.45 
 
 		 961 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  25 
 
 		 1013 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 		 991 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 		 991 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  20.85 
 
 		 990 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2347  transposase Tn3  26.67 
 
 		 916 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.669911  normal  0.26387 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  22.39 
 
 		 994 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  24.43 
 
 		 1012 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  23.98 
 
 		 874 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  29.66 
 
 		 771 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  23.05 
 
 		 986 aa  55.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0116  transposase Tn3 family protein  21.96 
 
 		 1018 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  20.96 
 
 		 536 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.18 
 
 		 969 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  25.64 
 
 		 969 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2002  hypothetical protein  55.77 
 
 		 80 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.072506  normal  0.0379279 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  21.01 
 
 		 1006 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  21.01 
 
 		 1006 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  23.85 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  23.85 
 
 		 1004 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0916  hypothetical protein  32 
 
 		 111 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3975  hypothetical protein  22.07 
 
 		 236 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  33.71 
 
 		 969 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>