201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1731 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  59.2 
 
 		 1004 aa  1252    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 999 aa  2057    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  73.08 
 
 		 1059 aa  1533    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  56.09 
 
 		 1013 aa  1145    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  36.93 
 
 		 989 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  60.2 
 
 		 1007 aa  1224    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 999 aa  2057    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  45.93 
 
 		 990 aa  924    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  58.98 
 
 		 1004 aa  1236    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  60.2 
 
 		 1007 aa  1224    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  58.98 
 
 		 1004 aa  1236    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  38.04 
 
 		 1006 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  57.61 
 
 		 1012 aa  1182    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  37.32 
 
 		 990 aa  662    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  46.65 
 
 		 986 aa  930    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  38.04 
 
 		 1006 aa  684    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 999 aa  2057    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  39.32 
 
 		 1028 aa  694    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 999 aa  2057    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  36.94 
 
 		 994 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  34.54 
 
 		 995 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  34.11 
 
 		 995 aa  602  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  35.75 
 
 		 993 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  35.75 
 
 		 993 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  27.51 
 
 		 988 aa  296  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  27.18 
 
 		 988 aa  296  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  27.18 
 
 		 988 aa  296  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26.27 
 
 		 988 aa  291  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26.27 
 
 		 988 aa  291  6e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  26.69 
 
 		 988 aa  290  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.33 
 
 		 988 aa  289  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26.67 
 
 		 988 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  26.61 
 
 		 988 aa  288  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  26.61 
 
 		 988 aa  288  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  26.61 
 
 		 988 aa  288  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  26.61 
 
 		 988 aa  288  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.47 
 
 		 988 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  26.75 
 
 		 988 aa  283  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26.15 
 
 		 988 aa  283  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.78 
 
 		 964 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  26.77 
 
 		 989 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5145  transposase Tn3  43.56 
 
 		 335 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.904999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 		 1015 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  26.09 
 
 		 989 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  25.81 
 
 		 990 aa  270  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  25.81 
 
 		 990 aa  270  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  25.81 
 
 		 990 aa  270  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  25.81 
 
 		 990 aa  269  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  25.97 
 
 		 990 aa  268  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  25.71 
 
 		 990 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  25.71 
 
 		 990 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  26.89 
 
 		 985 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.9 
 
 		 983 aa  254  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  30.26 
 
 		 536 aa  252  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  24.37 
 
 		 974 aa  251  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  25.18 
 
 		 950 aa  245  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.91 
 
 		 992 aa  244  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 988 aa  244  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 988 aa  244  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  26.38 
 
 		 988 aa  244  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 		 994 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.16 
 
 		 994 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  24.68 
 
 		 987 aa  241  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 		 969 aa  239  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  30.25 
 
 		 606 aa  239  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.33 
 
 		 755 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.36 
 
 		 862 aa  231  6e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.97 
 
 		 994 aa  228  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.68 
 
 		 1006 aa  220  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.13 
 
 		 988 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 976 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.65 
 
 		 924 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 969 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  25.3 
 
 		 983 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  25.61 
 
 		 961 aa  199  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  199  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  197  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  29.14 
 
 		 550 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  197  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.03 
 
 		 996 aa  197  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  23.19 
 
 		 988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.69 
 
 		 991 aa  191  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.69 
 
 		 991 aa  191  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  26.35 
 
 		 992 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  26.35 
 
 		 992 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.55 
 
 		 968 aa  189  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.92 
 
 		 771 aa  188  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  24.72 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.67 
 
 		 988 aa  186  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  25.41 
 
 		 877 aa  184  9.000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.96 
 
 		 997 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  21.24 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  21.24 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  22.31 
 
 		 1028 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.94 
 
 		 991 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  25.91 
 
 		 815 aa  175  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  24.75 
 
 		 772 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.44 
 
 		 999 aa  169  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 		 874 aa  166  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 		 305 aa  160  9e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>