197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3718 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
305 aa  630  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  77.55 
 
 
988 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  77.55 
 
 
988 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  77.55 
 
 
988 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  77.55 
 
 
988 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  77.55 
 
 
988 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  77.21 
 
 
988 aa  488  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  77.55 
 
 
964 aa  489  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  76.79 
 
 
988 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  77.21 
 
 
988 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  78.01 
 
 
988 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  77.13 
 
 
988 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  77.13 
 
 
988 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  76.87 
 
 
988 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  77.03 
 
 
988 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  77.03 
 
 
606 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  76.27 
 
 
989 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  76.29 
 
 
988 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  76.29 
 
 
988 aa  479  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  75.85 
 
 
990 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  75.85 
 
 
990 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  74.83 
 
 
755 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  74.83 
 
 
990 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  74.83 
 
 
990 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  74.83 
 
 
990 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  74.83 
 
 
990 aa  468  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  75.17 
 
 
990 aa  470  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  72.97 
 
 
989 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  76.57 
 
 
310 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  71.58 
 
 
1015 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  71.58 
 
 
985 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  69.26 
 
 
988 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  69.26 
 
 
988 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  69.26 
 
 
988 aa  437  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  76.08 
 
 
255 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  65.64 
 
 
994 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  65.64 
 
 
550 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  65.64 
 
 
994 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  65.64 
 
 
862 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  63.92 
 
 
994 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  54.58 
 
 
992 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  54.46 
 
 
996 aa  341  9e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  54.3 
 
 
992 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  54.3 
 
 
992 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  54.13 
 
 
996 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  54.13 
 
 
996 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  54.13 
 
 
996 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  51.74 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  53.61 
 
 
983 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  53.15 
 
 
987 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  51.23 
 
 
988 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  51.23 
 
 
988 aa  318  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  53.12 
 
 
961 aa  315  5e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  53.12 
 
 
546 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  50.34 
 
 
988 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  50.7 
 
 
371 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  73.47 
 
 
203 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  50.69 
 
 
999 aa  295  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  52.16 
 
 
573 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  49.66 
 
 
991 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  49.31 
 
 
991 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  49.31 
 
 
991 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  49.48 
 
 
983 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  50.35 
 
 
772 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.84 
 
 
246 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.84 
 
 
246 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  77.65 
 
 
339 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  79.01 
 
 
264 aa  267  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  79.75 
 
 
161 aa  263  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  62.69 
 
 
224 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  46.3 
 
 
217 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  36.18 
 
 
771 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  36.73 
 
 
435 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  36.79 
 
 
1006 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  37.5 
 
 
997 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  52.25 
 
 
179 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  39.47 
 
 
924 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  72.27 
 
 
126 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  72.27 
 
 
126 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  72.27 
 
 
126 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  39.47 
 
 
976 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  47.22 
 
 
877 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 
990 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  35.76 
 
 
1029 aa  175  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  36.8 
 
 
986 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  33.79 
 
 
991 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  33.79 
 
 
991 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  35.94 
 
 
989 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  35.09 
 
 
994 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  36.19 
 
 
993 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 
993 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  36.03 
 
 
1019 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 
995 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  36.72 
 
 
990 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  33.66 
 
 
1075 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  32.98 
 
 
995 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 
999 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 
999 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 
999 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  36.5 
 
 
999 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>