169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3995 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  100 
 
 
126 aa  254  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
964 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  68.6 
 
 
988 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  68.6 
 
 
988 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  68.6 
 
 
989 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  70.59 
 
 
339 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  68.6 
 
 
988 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  68.6 
 
 
988 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  69.42 
 
 
988 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
988 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
990 aa  183  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  69.42 
 
 
755 aa  183  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
988 aa  183  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
990 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
990 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
990 aa  183  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  69.42 
 
 
990 aa  183  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  68.6 
 
 
988 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  69.42 
 
 
990 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  71.55 
 
 
988 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  69.42 
 
 
990 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  71.55 
 
 
988 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  71.55 
 
 
606 aa  182  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  71.55 
 
 
310 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  71.55 
 
 
255 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  67.77 
 
 
988 aa  181  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  71.55 
 
 
203 aa  181  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  69.83 
 
 
988 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  69.83 
 
 
988 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  67.77 
 
 
988 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  67.77 
 
 
988 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  72.27 
 
 
305 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  68.6 
 
 
161 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  66.94 
 
 
1015 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  69.49 
 
 
264 aa  178  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  66.94 
 
 
989 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  68.1 
 
 
988 aa  173  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  68.1 
 
 
988 aa  173  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  68.1 
 
 
988 aa  173  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  70.34 
 
 
224 aa  173  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  65.83 
 
 
994 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  64.17 
 
 
862 aa  169  9e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  64.17 
 
 
994 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  64.17 
 
 
550 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  64.17 
 
 
994 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  65.81 
 
 
985 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  60.66 
 
 
991 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  61.86 
 
 
999 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  58.62 
 
 
992 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  58.47 
 
 
991 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  58.47 
 
 
991 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  62.93 
 
 
996 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  62.93 
 
 
996 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  62.93 
 
 
996 aa  147  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  60.17 
 
 
996 aa  147  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  51.67 
 
 
988 aa  135  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  49.57 
 
 
988 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  49.57 
 
 
988 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  52.14 
 
 
992 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  52.14 
 
 
992 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  56.73 
 
 
983 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  52.21 
 
 
179 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  51.72 
 
 
983 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  49.56 
 
 
338 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  52.88 
 
 
546 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  49.56 
 
 
246 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  53.4 
 
 
961 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  49.56 
 
 
246 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  52.88 
 
 
112 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  52.53 
 
 
987 aa  116  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  46.9 
 
 
217 aa  116  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  44.25 
 
 
371 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  50.49 
 
 
573 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  47.57 
 
 
772 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  45.54 
 
 
997 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  43.75 
 
 
1006 aa  89.4  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  37.72 
 
 
435 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  37.17 
 
 
771 aa  84  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  40.68 
 
 
991 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  40.68 
 
 
991 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  44.32 
 
 
924 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  44.32 
 
 
976 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0102  hypothetical protein  38.71 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  34.21 
 
 
1029 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  36.61 
 
 
1028 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0012  putative transposase  45.45 
 
 
71 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.65506  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  34.82 
 
 
838 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  38.14 
 
 
1075 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  31 
 
 
977 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  31 
 
 
977 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
1028 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1488  hypothetical protein  58.97 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0200539  normal  0.398384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
1028 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
1026 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  34.34 
 
 
1026 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  30.63 
 
 
1019 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  30.7 
 
 
989 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  33.98 
 
 
928 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>