190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0355 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0355  transposase  100 
 
 
224 aa  455  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  82 
 
 
994 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  79.81 
 
 
994 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  79.81 
 
 
994 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  79.81 
 
 
862 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  79.81 
 
 
550 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  68.66 
 
 
755 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  68.66 
 
 
990 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  68.66 
 
 
990 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
990 aa  281  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
990 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
990 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
990 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 
990 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  68.16 
 
 
989 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  68.66 
 
 
988 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  68.66 
 
 
988 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  68.47 
 
 
964 aa  275  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  68.47 
 
 
988 aa  275  5e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  68.47 
 
 
988 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  67.98 
 
 
988 aa  274  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  67.98 
 
 
988 aa  274  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  67.98 
 
 
988 aa  274  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  67.98 
 
 
988 aa  274  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  67.49 
 
 
988 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  67 
 
 
989 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  67.49 
 
 
988 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  67.49 
 
 
988 aa  270  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  64.22 
 
 
988 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  64.22 
 
 
988 aa  270  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  66.83 
 
 
1015 aa  267  1e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  65.2 
 
 
988 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  65.2 
 
 
988 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  65.2 
 
 
310 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  65.2 
 
 
606 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  65.2 
 
 
255 aa  265  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  67.86 
 
 
203 aa  264  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  62.69 
 
 
985 aa  252  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  73.21 
 
 
339 aa  250  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  62.69 
 
 
305 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  65.98 
 
 
988 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  65.98 
 
 
988 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  65.98 
 
 
988 aa  249  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  70.83 
 
 
264 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  70.7 
 
 
161 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  56.61 
 
 
992 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  57.95 
 
 
996 aa  225  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  56.92 
 
 
996 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  56.92 
 
 
996 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  56.92 
 
 
996 aa  222  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  55.22 
 
 
991 aa  214  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  55.98 
 
 
999 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  53.92 
 
 
991 aa  207  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  53.92 
 
 
991 aa  207  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  56.04 
 
 
992 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  56.04 
 
 
992 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.53 
 
 
338 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  48.53 
 
 
246 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  49.51 
 
 
246 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  59.88 
 
 
983 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  50.25 
 
 
983 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  55.75 
 
 
961 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  55.75 
 
 
546 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  47.55 
 
 
217 aa  194  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  52.87 
 
 
988 aa  193  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  56.79 
 
 
179 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  51.41 
 
 
988 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  51.41 
 
 
988 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  45.83 
 
 
371 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  50.27 
 
 
987 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  70.34 
 
 
126 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  70.34 
 
 
126 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  70.34 
 
 
126 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  51.88 
 
 
573 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  51.88 
 
 
772 aa  164  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  37.78 
 
 
435 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  42.16 
 
 
997 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  39.29 
 
 
1006 aa  132  6e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  36.41 
 
 
771 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  39.63 
 
 
924 aa  121  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  39.63 
 
 
976 aa  121  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  53.21 
 
 
112 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  37.99 
 
 
991 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  37.99 
 
 
991 aa  112  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  36.02 
 
 
989 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  32.81 
 
 
986 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  32.94 
 
 
977 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4775  transposase Tn3 family protein  35.68 
 
 
838 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.855357  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  36.59 
 
 
993 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  36.59 
 
 
993 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4556  transposase Tn3 family protein  36.71 
 
 
1028 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.875652 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3470  transposase Tn3 family protein  36.71 
 
 
1028 aa  102  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0192  transposase Tn3 family protein  36.71 
 
 
1026 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1989  transposase Tn3 family protein  36.71 
 
 
1026 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  36.09 
 
 
212 aa  101  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_24  transposase  35.4 
 
 
1019 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.207727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  32.93 
 
 
989 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 
977 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  32.3 
 
 
977 aa  99.4  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  34.31 
 
 
1029 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>