201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1639 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 977 aa  1982    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  59.98 
 
 		 977 aa  1191    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 977 aa  1982    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  51.08 
 
 		 989 aa  958    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  47.88 
 
 		 762 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  38.7 
 
 		 969 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  38.7 
 
 		 969 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  38.7 
 
 		 969 aa  633  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  37.28 
 
 		 971 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  37.18 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  37.18 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  37.18 
 
 		 971 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  39.5 
 
 		 946 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  39.5 
 
 		 946 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  35.82 
 
 		 978 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  37.4 
 
 		 970 aa  594  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  36.08 
 
 		 980 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  36.14 
 
 		 979 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  35.86 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  35.54 
 
 		 979 aa  561  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 		 972 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  39.97 
 
 		 766 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  34.38 
 
 		 845 aa  429  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 		 633 aa  298  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  32.43 
 
 		 799 aa  297  6e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  25.61 
 
 		 983 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.73 
 
 		 987 aa  237  9e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.57 
 
 		 988 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.57 
 
 		 988 aa  228  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.11 
 
 		 988 aa  226  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.64 
 
 		 988 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.9 
 
 		 992 aa  219  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  32.23 
 
 		 409 aa  218  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.38 
 
 		 988 aa  211  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.75 
 
 		 989 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 		 964 aa  207  6e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.61 
 
 		 988 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.56 
 
 		 968 aa  207  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.41 
 
 		 988 aa  206  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.3 
 
 		 988 aa  204  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.3 
 
 		 988 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.3 
 
 		 988 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.3 
 
 		 988 aa  204  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  23.14 
 
 		 1015 aa  204  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.28 
 
 		 988 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.16 
 
 		 988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 976 aa  202  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  23.81 
 
 		 994 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  26.59 
 
 		 924 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.37 
 
 		 991 aa  198  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.37 
 
 		 991 aa  198  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.15 
 
 		 990 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.15 
 
 		 990 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.25 
 
 		 990 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  44.92 
 
 		 254 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 990 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 990 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24 
 
 		 990 aa  194  6e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.9 
 
 		 961 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.08 
 
 		 990 aa  191  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.23 
 
 		 994 aa  190  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.17 
 
 		 989 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 974 aa  188  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  24.39 
 
 		 985 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.03 
 
 		 1006 aa  186  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.26 
 
 		 862 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  25.71 
 
 		 755 aa  179  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.92 
 
 		 992 aa  178  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.92 
 
 		 992 aa  178  5e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.94 
 
 		 988 aa  177  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 999 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 		 772 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.84 
 
 		 988 aa  175  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.85 
 
 		 991 aa  174  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  25.09 
 
 		 988 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  24.59 
 
 		 988 aa  173  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  24.59 
 
 		 988 aa  173  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  24.59 
 
 		 988 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 		 969 aa  172  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  24.64 
 
 		 606 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  23.04 
 
 		 969 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 550 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  22.93 
 
 		 997 aa  163  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  28.01 
 
 		 371 aa  161  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  23.61 
 
 		 983 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  23.54 
 
 		 950 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  24.7 
 
 		 874 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  23.45 
 
 		 988 aa  153  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.22 
 
 		 996 aa  151  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>