190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0645 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  46.22 
 
 		 978 aa  844    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  39.22 
 
 		 977 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  44.15 
 
 		 845 aa  645    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  78.78 
 
 		 971 aa  1558    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  78.78 
 
 		 971 aa  1558    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  47.08 
 
 		 979 aa  844    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  81.74 
 
 		 766 aa  1207    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  73.46 
 
 		 633 aa  913    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 970 aa  1959    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  78.78 
 
 		 971 aa  1558    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  74.04 
 
 		 799 aa  927    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  45.57 
 
 		 928 aa  786    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  78.89 
 
 		 971 aa  1560    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  78.78 
 
 		 971 aa  1558    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  78.78 
 
 		 971 aa  1558    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  71.58 
 
 		 946 aa  1351    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  71.75 
 
 		 969 aa  1398    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  71.75 
 
 		 969 aa  1398    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  71.75 
 
 		 969 aa  1398    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  71.58 
 
 		 946 aa  1351    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  46.95 
 
 		 979 aa  860    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  46.96 
 
 		 980 aa  848    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  37.4 
 
 		 977 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  37.4 
 
 		 977 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  37.3 
 
 		 989 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  37.2 
 
 		 972 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  34.87 
 
 		 762 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  69.71 
 
 		 247 aa  362  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.86 
 
 		 983 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.82 
 
 		 987 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  23.99 
 
 		 1015 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  81.2 
 
 		 117 aa  198  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.38 
 
 		 988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.38 
 
 		 988 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 		 988 aa  188  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  22.77 
 
 		 988 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  41.95 
 
 		 254 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.96 
 
 		 988 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.48 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.48 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.48 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.48 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.39 
 
 		 988 aa  187  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  22.87 
 
 		 989 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  24.33 
 
 		 992 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  24.33 
 
 		 992 aa  184  6e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  22.36 
 
 		 964 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  22.69 
 
 		 988 aa  183  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  22.93 
 
 		 988 aa  180  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  22.93 
 
 		 988 aa  181  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.52 
 
 		 992 aa  180  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.82 
 
 		 999 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  22.52 
 
 		 994 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  22.52 
 
 		 994 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  22.19 
 
 		 989 aa  179  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  22.37 
 
 		 988 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  22.37 
 
 		 988 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  23.44 
 
 		 862 aa  177  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.18 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.18 
 
 		 991 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 990 aa  174  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 990 aa  174  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 990 aa  174  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  21.85 
 
 		 990 aa  173  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  25 
 
 		 606 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  22.81 
 
 		 990 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  22.81 
 
 		 990 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.11 
 
 		 994 aa  171  5e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 		 990 aa  171  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  23.03 
 
 		 988 aa  171  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  23.03 
 
 		 988 aa  171  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  23.03 
 
 		 988 aa  171  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  25.95 
 
 		 991 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.06 
 
 		 985 aa  164  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.98 
 
 		 961 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  25.27 
 
 		 371 aa  159  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  26.02 
 
 		 988 aa  158  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.51 
 
 		 997 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  23.27 
 
 		 755 aa  151  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  26.61 
 
 		 338 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  24.11 
 
 		 991 aa  149  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  24.11 
 
 		 991 aa  149  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 996 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 996 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 996 aa  147  7.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  23.3 
 
 		 996 aa  147  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 772 aa  145  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  29.34 
 
 		 409 aa  142  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.68 
 
 		 988 aa  141  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  29.81 
 
 		 305 aa  141  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.29 
 
 		 988 aa  140  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22 
 
 		 974 aa  138  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.79 
 
 		 968 aa  138  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>