123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6455 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 971 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  99.15 
 
 		 766 aa  238  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6455  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  236  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  81.2 
 
 		 970 aa  197  3e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  78.63 
 
 		 946 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  78.63 
 
 		 969 aa  191  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  78.63 
 
 		 969 aa  191  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  78.63 
 
 		 969 aa  191  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  78.63 
 
 		 946 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  50.47 
 
 		 978 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  49.53 
 
 		 928 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  46.73 
 
 		 979 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  38.89 
 
 		 977 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  38.89 
 
 		 977 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  38.61 
 
 		 977 aa  97.4  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  46.73 
 
 		 979 aa  94.7  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  45.79 
 
 		 980 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  38.89 
 
 		 989 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  42.98 
 
 		 845 aa  76.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  33.33 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  33.33 
 
 		 972 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  37.78 
 
 		 992 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  37.78 
 
 		 992 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  32.98 
 
 		 983 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  29.59 
 
 		 246 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  31.87 
 
 		 546 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  31.87 
 
 		 961 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  31.91 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2047  transposase  28.57 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4366  TnpA family transposase  38.04 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.914851 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  28.57 
 
 		 338 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  28.57 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0079  transposase  32.61 
 
 		 435 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.776565  normal  0.783345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  30.43 
 
 		 997 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  28.16 
 
 		 988 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  28.16 
 
 		 988 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  28.16 
 
 		 988 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0355  transposase  29.79 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  26.47 
 
 		 371 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  31.87 
 
 		 573 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  29.79 
 
 		 987 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  34.38 
 
 		 994 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  27.66 
 
 		 991 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  27.66 
 
 		 991 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  30.85 
 
 		 988 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  30.85 
 
 		 988 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  28.44 
 
 		 1006 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3995  Tn3 family transposase  28.57 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1277  Tn3 family transposase  28.57 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3243  Tn3 family transposase  28.57 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.744119  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  28.41 
 
 		 994 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  28.41 
 
 		 550 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  28.41 
 
 		 994 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  28.41 
 
 		 862 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  29.46 
 
 		 988 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  28.3 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.32 
 
 		 999 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  29.46 
 
 		 988 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4112  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 		 1006 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  29.46 
 
 		 988 aa  48.1  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  28.3 
 
 		 339 aa  47.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8035  transposase  28.41 
 
 		 179 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  28.72 
 
 		 989 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  29.46 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  29.46 
 
 		 989 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  29.46 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  29.46 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 964 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  27.36 
 
 		 264 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  31 
 
 		 771 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  29.46 
 
 		 988 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  27.91 
 
 		 992 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  28.57 
 
 		 755 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 990 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 990 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 990 aa  45.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 		 988 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 		 988 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 990 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  31.91 
 
 		 985 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  27.27 
 
 		 991 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01406  Transposase Tn3  29.29 
 
 		 267 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  28.57 
 
 		 990 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  27.27 
 
 		 310 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  27.27 
 
 		 255 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3479  Tn5044 transposase  26.6 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  28.72 
 
 		 988 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  27.27 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>