139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1853 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  53.71 
 
 
977 aa  815    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  47.88 
 
 
977 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  63.53 
 
 
989 aa  968    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  47.88 
 
 
977 aa  683    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
762 aa  1555    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  34.7 
 
 
971 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  34.7 
 
 
971 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  34.7 
 
 
971 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  34.83 
 
 
971 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  34.7 
 
 
971 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  34.7 
 
 
971 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  35.03 
 
 
969 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  35.03 
 
 
969 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  35.03 
 
 
969 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  34.87 
 
 
970 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  33.03 
 
 
978 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  33.2 
 
 
980 aa  391  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  35.55 
 
 
946 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  35.55 
 
 
946 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  32.15 
 
 
979 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  33.57 
 
 
928 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  32.68 
 
 
979 aa  360  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  32.36 
 
 
972 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  33.66 
 
 
845 aa  310  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  35.16 
 
 
766 aa  283  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  31.46 
 
 
633 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  31.11 
 
 
799 aa  274  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  30.56 
 
 
409 aa  180  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5784  IS1071, transposase  34.3 
 
 
247 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978933  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  20.55 
 
 
983 aa  122  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  21.35 
 
 
987 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  20.72 
 
 
988 aa  98.2  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  20.72 
 
 
988 aa  98.2  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  24.36 
 
 
968 aa  93.6  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  20.94 
 
 
988 aa  89.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  19.89 
 
 
738 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  19.22 
 
 
992 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  20.52 
 
 
989 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  20.81 
 
 
988 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  20.6 
 
 
988 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  21.32 
 
 
988 aa  85.5  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  21.7 
 
 
988 aa  83.2  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  20.29 
 
 
988 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  20.29 
 
 
988 aa  82.4  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  20.29 
 
 
988 aa  82.4  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  20.29 
 
 
988 aa  82.4  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  21.95 
 
 
1015 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  20.7 
 
 
988 aa  82  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  20.81 
 
 
964 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.13 
 
 
994 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.01 
 
 
994 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  22.04 
 
 
983 aa  79.7  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  20.18 
 
 
989 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  21.87 
 
 
990 aa  78.6  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  21.9 
 
 
990 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  21.9 
 
 
990 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  25.9 
 
 
772 aa  77.8  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.54 
 
 
990 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.54 
 
 
990 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.54 
 
 
990 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  20.51 
 
 
994 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.6 
 
 
990 aa  76.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  19.59 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  22.54 
 
 
996 aa  73.9  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  21.46 
 
 
862 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  22.57 
 
 
1006 aa  73.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  22.61 
 
 
606 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  22.29 
 
 
988 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  22.29 
 
 
988 aa  73.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  22.61 
 
 
988 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.29 
 
 
988 aa  73.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.09 
 
 
999 aa  72.8  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  20.23 
 
 
989 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  25.44 
 
 
771 aa  72.4  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  20.63 
 
 
991 aa  71.6  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  22.29 
 
 
988 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.12 
 
 
988 aa  70.5  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  25.16 
 
 
573 aa  69.7  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.01 
 
 
985 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  21.2 
 
 
755 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  19.97 
 
 
731 aa  67.4  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 
988 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 
988 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  21.91 
 
 
988 aa  65.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  21.67 
 
 
991 aa  64.7  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  21.67 
 
 
991 aa  64.7  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
996 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
996 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  21.48 
 
 
996 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  20.89 
 
 
550 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  21.73 
 
 
990 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5543  hypothetical protein  29.84 
 
 
186 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.661737 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  23.64 
 
 
950 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.29 
 
 
961 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>