205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1323 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  51.08 
 
 
977 aa  974    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  55.74 
 
 
977 aa  1098    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
989 aa  2000    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  63.53 
 
 
762 aa  939    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  51.08 
 
 
977 aa  974    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  38.36 
 
 
969 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  38.36 
 
 
969 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  38.36 
 
 
969 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  37.1 
 
 
971 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  37 
 
 
971 aa  602  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  37 
 
 
971 aa  602  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  37 
 
 
971 aa  602  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  37 
 
 
971 aa  602  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  37 
 
 
971 aa  602  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  38.74 
 
 
946 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  38.74 
 
 
946 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  36.98 
 
 
970 aa  588  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  35.83 
 
 
980 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  35.56 
 
 
978 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  36.36 
 
 
979 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  36.21 
 
 
979 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  36.03 
 
 
972 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  35.8 
 
 
928 aa  532  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  39.37 
 
 
766 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  36.13 
 
 
845 aa  452  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.84 
 
 
983 aa  269  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.71 
 
 
987 aa  267  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  30.65 
 
 
799 aa  263  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  30.67 
 
 
633 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  24.97 
 
 
988 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  24.97 
 
 
988 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.46 
 
 
988 aa  229  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  23.89 
 
 
1015 aa  222  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.98 
 
 
988 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.94 
 
 
989 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.28 
 
 
964 aa  221  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  24.03 
 
 
988 aa  221  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  24.8 
 
 
988 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  24.01 
 
 
994 aa  217  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.98 
 
 
988 aa  217  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.98 
 
 
988 aa  217  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.98 
 
 
988 aa  217  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.98 
 
 
988 aa  217  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.91 
 
 
994 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.51 
 
 
991 aa  214  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.51 
 
 
991 aa  214  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  23.4 
 
 
990 aa  214  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.2 
 
 
988 aa  214  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  23.72 
 
 
990 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  23.71 
 
 
988 aa  213  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  23.4 
 
 
990 aa  213  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  23.72 
 
 
990 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
990 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
990 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  23.32 
 
 
990 aa  212  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  23.66 
 
 
988 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  25.68 
 
 
1006 aa  209  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 
988 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  24.38 
 
 
862 aa  208  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  23.51 
 
 
988 aa  208  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  23.51 
 
 
988 aa  208  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  25.43 
 
 
997 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.04 
 
 
992 aa  205  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  22.87 
 
 
994 aa  204  6e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  26.69 
 
 
755 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 
988 aa  201  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 
988 aa  201  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 
988 aa  201  6e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.8 
 
 
606 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  46.85 
 
 
254 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  24.1 
 
 
989 aa  197  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 
988 aa  197  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.06 
 
 
988 aa  194  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  26.82 
 
 
550 aa  194  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.54 
 
 
991 aa  194  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.06 
 
 
961 aa  194  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  31.83 
 
 
371 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  23.04 
 
 
985 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  25.74 
 
 
999 aa  191  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  31.83 
 
 
409 aa  190  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  25.08 
 
 
992 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  25.08 
 
 
992 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.14 
 
 
968 aa  189  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  22.62 
 
 
990 aa  185  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  27.07 
 
 
771 aa  183  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.04 
 
 
772 aa  178  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.95 
 
 
546 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  27.78 
 
 
573 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 
996 aa  173  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.9 
 
 
976 aa  172  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.51 
 
 
974 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.64 
 
 
924 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  29.66 
 
 
338 aa  161  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.25 
 
 
996 aa  160  8e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>