203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2470 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  38.06 
 
 
971 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  38.06 
 
 
971 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  100 
 
 
977 aa  1998    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  37.95 
 
 
971 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  37.95 
 
 
971 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  38.06 
 
 
971 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  38.06 
 
 
971 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  38.06 
 
 
971 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  59.98 
 
 
977 aa  1191    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  59.98 
 
 
977 aa  1191    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  37.95 
 
 
971 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  38.06 
 
 
971 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  55.74 
 
 
989 aa  1076    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  53.71 
 
 
762 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  38.06 
 
 
971 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  37.95 
 
 
971 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  37.95 
 
 
971 aa  637    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  38.83 
 
 
969 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  38.83 
 
 
969 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  38.83 
 
 
969 aa  647    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  39.22 
 
 
970 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  39.19 
 
 
946 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  39.19 
 
 
946 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  36.52 
 
 
978 aa  612  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  36.48 
 
 
980 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  36.65 
 
 
979 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  35.63 
 
 
979 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  36.29 
 
 
928 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  35.59 
 
 
972 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  39.72 
 
 
766 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  35.07 
 
 
845 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  32.58 
 
 
633 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  32.69 
 
 
799 aa  303  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.92 
 
 
983 aa  268  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.97 
 
 
987 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  23.89 
 
 
988 aa  227  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  23.89 
 
 
988 aa  227  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  24.1 
 
 
1015 aa  224  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1877  transposase Tn3  33.84 
 
 
409 aa  221  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  24.97 
 
 
988 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  23.64 
 
 
994 aa  214  9e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  24.18 
 
 
988 aa  212  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  23.7 
 
 
988 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  24.42 
 
 
990 aa  210  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 
990 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 
990 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  24.17 
 
 
990 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.72 
 
 
988 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  24.07 
 
 
990 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  24.07 
 
 
990 aa  209  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  23.28 
 
 
994 aa  208  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  24.64 
 
 
988 aa  208  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  24.67 
 
 
988 aa  207  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  23.27 
 
 
989 aa  206  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  24.06 
 
 
990 aa  207  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.96 
 
 
988 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  23.28 
 
 
994 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  26.35 
 
 
988 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  26.35 
 
 
606 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.99 
 
 
992 aa  204  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.45 
 
 
961 aa  204  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  24.59 
 
 
988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  24.59 
 
 
988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  24.59 
 
 
988 aa  203  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  26 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  24.06 
 
 
964 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  26 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  26 
 
 
988 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  22.93 
 
 
988 aa  202  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  22.93 
 
 
988 aa  202  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  22.93 
 
 
988 aa  202  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  22.93 
 
 
988 aa  202  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  23.65 
 
 
988 aa  201  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.09 
 
 
755 aa  198  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  23.56 
 
 
989 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24.62 
 
 
991 aa  196  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24.62 
 
 
991 aa  196  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.03 
 
 
991 aa  196  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.4 
 
 
1006 aa  192  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  42.32 
 
 
254 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  22.63 
 
 
985 aa  192  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.95 
 
 
862 aa  190  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25.61 
 
 
968 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  31.59 
 
 
371 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  25.52 
 
 
550 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  27.33 
 
 
772 aa  180  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.95 
 
 
976 aa  178  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.23 
 
 
924 aa  177  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  24.75 
 
 
997 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 
999 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  23.9 
 
 
992 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  23.9 
 
 
992 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.27 
 
 
996 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.63 
 
 
771 aa  171  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
996 aa  167  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
996 aa  167  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  23.83 
 
 
996 aa  167  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  27.03 
 
 
546 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  26.78 
 
 
573 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  23.19 
 
 
983 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>