185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5545 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5683  transposase Tn3 family protein  54.69 
 
 		 979 aa  911    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7306  transposase Tn3 family protein  53 
 
 		 980 aa  896    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045557 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6491  transposase Tn3  43.78 
 
 		 971 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6590  transposase Tn3  54.69 
 
 		 978 aa  913    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5545  transposase Tn3  100 
 
 		 845 aa  1733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.288068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1179  transposase  43.66 
 
 		 971 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1202  transposase Tn3  43.66 
 
 		 971 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.773919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6212  transposase Tn3  54.5 
 
 		 979 aa  909    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1491  transposase Tn3  43.78 
 
 		 971 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200798  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1506  transposase Tn3  43.78 
 
 		 971 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0432891  hitchhiker  0.006326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1544  transposase Tn3  43.78 
 
 		 971 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.121615  normal  0.953447 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4228  transposase Tn3 family protein  43.66 
 
 		 971 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.260644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4288  transposase Tn3 family protein  43.78 
 
 		 971 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2241  transposase Tn3 family protein  43.78 
 
 		 971 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86312  normal  0.995044 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3007  transposase Tn3 family protein  43.66 
 
 		 971 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3044  transposase Tn3 family protein  43.66 
 
 		 971 aa  655    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0069  TnpA family transposase  43.93 
 
 		 946 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.724381  hitchhiker  0.00503767 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0418  TnpA family transposase  43.93 
 
 		 969 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.524573  normal  0.229677 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0454  TnpA family transposase  43.93 
 
 		 969 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0489  TnpA family transposase  43.93 
 
 		 969 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.384834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0570  TnpA family transposase  43.93 
 
 		 946 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569559 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5798  transposase Tn3 family protein  54.02 
 
 		 928 aa  909    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0684485 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5146  transposase Tn3 family protein  43.78 
 
 		 971 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.427024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0645  transposase Tn3 family protein  44.15 
 
 		 970 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0794164 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5786  transposase Tn3 family protein  45.34 
 
 		 766 aa  595  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2470  transposase Tn3  35.31 
 
 		 977 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0197511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1323  transposase Tn3 family protein  36.19 
 
 		 989 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.32373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1639  transposase Tn3 family protein  34.38 
 
 		 977 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0647401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5280  transposase Tn3 family protein  34.38 
 
 		 977 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5075  transposase Tn3 family protein  34.13 
 
 		 972 aa  456  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4279  transposase Tn3 family protein  38.57 
 
 		 799 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0330145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6617  transposase Tn3 family protein  38.59 
 
 		 633 aa  300  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1853  transposase Tn3 family protein  33.66 
 
 		 762 aa  287  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.713988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.81 
 
 		 987 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5076  TnpA family transposase  40.73 
 
 		 254 aa  171  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  24.61 
 
 		 983 aa  160  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  19.95 
 
 		 992 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  20.99 
 
 		 988 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  20.99 
 
 		 988 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  23.87 
 
 		 988 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  23.87 
 
 		 988 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  23.87 
 
 		 988 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  23.87 
 
 		 988 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  23.43 
 
 		 964 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  23.25 
 
 		 988 aa  134  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  21.45 
 
 		 994 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  22.25 
 
 		 988 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  21.45 
 
 		 994 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  23.08 
 
 		 988 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  21.45 
 
 		 862 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  21.22 
 
 		 988 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  21.77 
 
 		 988 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  22.25 
 
 		 988 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  22.25 
 
 		 988 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  22.25 
 
 		 988 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  22.97 
 
 		 989 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  23.21 
 
 		 988 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  24.96 
 
 		 997 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  21.61 
 
 		 988 aa  128  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  26.19 
 
 		 371 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  22.86 
 
 		 606 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  20.8 
 
 		 1015 aa  127  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  21.64 
 
 		 988 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  21.64 
 
 		 988 aa  127  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  23.16 
 
 		 550 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  21.56 
 
 		 990 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  25.93 
 
 		 338 aa  122  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  21.56 
 
 		 990 aa  122  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  21.56 
 
 		 990 aa  121  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  21.56 
 
 		 990 aa  121  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  21.56 
 
 		 990 aa  121  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  22.63 
 
 		 771 aa  120  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  22.26 
 
 		 755 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  21.82 
 
 		 985 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.38 
 
 		 991 aa  117  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  23.13 
 
 		 999 aa  117  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  21.27 
 
 		 990 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  21.27 
 
 		 990 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  21.01 
 
 		 994 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  23.9 
 
 		 1006 aa  115  5e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  25 
 
 		 968 aa  115  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  21.12 
 
 		 989 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  22.81 
 
 		 969 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  23.53 
 
 		 961 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  23.1 
 
 		 1029 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.11 
 
 		 974 aa  110  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.24 
 
 		 991 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.24 
 
 		 991 aa  110  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  22.01 
 
 		 991 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  22.01 
 
 		 991 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  22.72 
 
 		 950 aa  107  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.4 
 
 		 996 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  21.52 
 
 		 988 aa  104  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  21.52 
 
 		 988 aa  104  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  21.91 
 
 		 573 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  24.71 
 
 		 310 aa  100  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  20.25 
 
 		 988 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  22.38 
 
 		 546 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02020  transposase  21.21 
 
 		 1019 aa  100  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  20.19 
 
 		 990 aa  97.8  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>