200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02944 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 999 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  37.18 
 
 		 1059 aa  646    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  52.92 
 
 		 989 aa  1070    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 999 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  50 
 
 		 993 aa  984    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  45.71 
 
 		 1006 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  50 
 
 		 993 aa  984    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  51.36 
 
 		 994 aa  994    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  45.5 
 
 		 995 aa  921    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  45.4 
 
 		 995 aa  921    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  36.62 
 
 		 1007 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 999 aa  672    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  45.71 
 
 		 1006 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  36.62 
 
 		 1007 aa  649    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  41.25 
 
 		 986 aa  773    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  100 
 
 		 990 aa  2051    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  37.32 
 
 		 999 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  39.76 
 
 		 990 aa  752    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  35.89 
 
 		 1004 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  36.16 
 
 		 1004 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  36.16 
 
 		 1004 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  35.48 
 
 		 1012 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  33.74 
 
 		 1013 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  35.72 
 
 		 1028 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  28.28 
 
 		 988 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  27.45 
 
 		 988 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  27.45 
 
 		 988 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  27.38 
 
 		 985 aa  304  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  26.41 
 
 		 988 aa  304  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  26.9 
 
 		 988 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  26.9 
 
 		 988 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  26.9 
 
 		 988 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  26.9 
 
 		 988 aa  303  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  26.18 
 
 		 988 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  26.67 
 
 		 989 aa  302  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  26.57 
 
 		 988 aa  299  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 		 964 aa  298  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  28.65 
 
 		 988 aa  298  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  28.42 
 
 		 988 aa  296  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  28.18 
 
 		 988 aa  295  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  28.18 
 
 		 988 aa  295  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.08 
 
 		 990 aa  295  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 990 aa  294  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  26.85 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.42 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.42 
 
 		 990 aa  294  7e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  26.27 
 
 		 988 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  26.15 
 
 		 989 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  25.86 
 
 		 1015 aa  275  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.01 
 
 		 983 aa  272  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  30.8 
 
 		 536 aa  266  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  24.26 
 
 		 1006 aa  259  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.87 
 
 		 969 aa  259  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 		 988 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 		 988 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  26.44 
 
 		 988 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  22.16 
 
 		 987 aa  255  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.63 
 
 		 755 aa  254  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  31.25 
 
 		 606 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 		 994 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.13 
 
 		 994 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  64.97 
 
 		 212 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  26.1 
 
 		 862 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  25.15 
 
 		 994 aa  238  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  24.04 
 
 		 950 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  22.91 
 
 		 974 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  21.58 
 
 		 992 aa  228  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 		 996 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 		 996 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  24.12 
 
 		 996 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  24.05 
 
 		 996 aa  229  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  23.97 
 
 		 997 aa  228  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.25 
 
 		 969 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  24.07 
 
 		 988 aa  227  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  23.49 
 
 		 991 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  24.36 
 
 		 924 aa  220  7.999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  25.39 
 
 		 992 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  25.39 
 
 		 992 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.78 
 
 		 991 aa  220  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.78 
 
 		 991 aa  220  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  24.36 
 
 		 976 aa  219  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  24 
 
 		 991 aa  218  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  24 
 
 		 991 aa  218  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.5 
 
 		 999 aa  217  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  24.35 
 
 		 961 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  23.91 
 
 		 1075 aa  205  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.14 
 
 		 983 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  21.17 
 
 		 988 aa  203  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.19 
 
 		 771 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  23.46 
 
 		 1029 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.6 
 
 		 550 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  28.97 
 
 		 546 aa  192  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  23.22 
 
 		 988 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  23.22 
 
 		 988 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  28.38 
 
 		 772 aa  187  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  23.17 
 
 		 877 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  22.51 
 
 		 1028 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  31.1 
 
 		 338 aa  181  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>