234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2321 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  71.62 
 
 		 988 aa  1474    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  71.62 
 
 		 988 aa  1474    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  69.92 
 
 		 989 aa  1432    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  39.77 
 
 		 961 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  45.55 
 
 		 996 aa  859    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  40.75 
 
 		 983 aa  770    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  54.31 
 
 		 994 aa  1057    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  44.23 
 
 		 992 aa  915    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  72.69 
 
 		 990 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  69.79 
 
 		 1015 aa  1427    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  41.94 
 
 		 988 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  41.94 
 
 		 988 aa  715    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  73.18 
 
 		 988 aa  1509    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  98.89 
 
 		 988 aa  1986    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  99.32 
 
 		 606 aa  1189    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  72.57 
 
 		 988 aa  1496    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  72.4 
 
 		 989 aa  1485    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  72.8 
 
 		 988 aa  1490    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  100 
 
 		 988 aa  2006    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  72.69 
 
 		 990 aa  1484    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  75.8 
 
 		 755 aa  1191    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  72.57 
 
 		 988 aa  1496    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  72.57 
 
 		 988 aa  1496    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  38.12 
 
 		 991 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  38.12 
 
 		 991 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3465  transposase Tn3 family protein  64.66 
 
 		 526 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  45.55 
 
 		 996 aa  859    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  45.55 
 
 		 996 aa  862    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  61.34 
 
 		 988 aa  1241    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  61.34 
 
 		 988 aa  1241    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  61.34 
 
 		 988 aa  1241    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  73.55 
 
 		 988 aa  1501    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  71.89 
 
 		 964 aa  1464    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  68.66 
 
 		 985 aa  1414    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  72.57 
 
 		 988 aa  1481    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  73.08 
 
 		 988 aa  1499    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3715  transposase Tn3 family protein  57.27 
 
 		 731 aa  839    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  71.98 
 
 		 990 aa  1472    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  71.98 
 
 		 990 aa  1472    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  71.98 
 
 		 990 aa  1472    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  37.89 
 
 		 991 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  45.55 
 
 		 996 aa  859    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  96.86 
 
 		 988 aa  1914    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  96.86 
 
 		 988 aa  1914    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  71.88 
 
 		 990 aa  1470    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  38.6 
 
 		 999 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  40.69 
 
 		 988 aa  763    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  41.39 
 
 		 987 aa  773    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  43.03 
 
 		 992 aa  752    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  43.03 
 
 		 992 aa  752    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  72.57 
 
 		 988 aa  1496    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  71.88 
 
 		 990 aa  1472    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  52.99 
 
 		 994 aa  1038    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  61.48 
 
 		 550 aa  679    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  53.1 
 
 		 994 aa  1040    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  55.28 
 
 		 862 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  37.46 
 
 		 877 aa  587  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0150  Tn1721 transposase  98.95 
 
 		 310 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.751061 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  35.28 
 
 		 983 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0035  transposase  99.22 
 
 		 255 aa  519  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.401081  normal  0.351265 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3676  transposase Tn3 family protein  38.46 
 
 		 772 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.635368 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0203  transposase  36.32 
 
 		 738 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000452446 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3718  transposase Tn3 family protein  77.03 
 
 		 305 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.396342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0072  transposase  46.41 
 
 		 546 aa  446  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.520579  normal  0.363066 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4311  TOBE domain-containing protein  43.03 
 
 		 573 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  31.09 
 
 		 1006 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1576  transposase  98.51 
 
 		 203 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0122395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  33.71 
 
 		 976 aa  405  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  31.29 
 
 		 997 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  32.44 
 
 		 968 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1821  transposase Tn3 family protein  36.32 
 
 		 612 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  34.78 
 
 		 924 aa  396  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0238  transposase  35.85 
 
 		 613 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1822  transposase Tn3 family protein  49.59 
 
 		 371 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 		 991 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  30.7 
 
 		 991 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2083  transposase Tn3 family protein  42.92 
 
 		 440 aa  356  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  48.53 
 
 		 338 aa  350  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  30.88 
 
 		 1028 aa  345  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5398  transposase Tn3 family protein  29.71 
 
 		 1029 aa  344  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0815937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0197  transposase  35.51 
 
 		 523 aa  339  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0358  transposase Tn3 family protein  61.65 
 
 		 273 aa  335  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4723  transposase, Tn3 family  29.87 
 
 		 1075 aa  330  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  26.69 
 
 		 989 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  35.4 
 
 		 771 aa  320  6e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  26.19 
 
 		 990 aa  304  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00623  transposase  25.84 
 
 		 986 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2317  transposase Tn3  87.43 
 
 		 339 aa  297  8e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000027108  hitchhiker  0.0000324498 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  28.31 
 
 		 990 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  27.52 
 
 		 999 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  26.3 
 
 		 1059 aa  289  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  26.21 
 
 		 994 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5050  TnpA family transposase  86.83 
 
 		 264 aa  283  1e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0202  transposase  51.42 
 
 		 246 aa  281  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.295684  hitchhiker  6.17068e-17 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0239  transposase  51.42 
 
 		 246 aa  280  9e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  26.08 
 
 		 1004 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3347  transposase Tn3  87.18 
 
 		 161 aa  273  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0077216  normal  0.4347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>