204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6606 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00623  transposase  39.33 
 
 
986 aa  691    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2512  transposase Tn3  59.27 
 
 
989 aa  1148    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227381  normal  0.0913005 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0025  transposase Tn3 family protein  43.38 
 
 
1006 aa  780    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1226  transposase Tn3  100 
 
 
993 aa  2041    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6606  transposase Tn3 family protein  100 
 
 
993 aa  2041    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0187013 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6852  transposase Tn3 family protein  67.04 
 
 
994 aa  1364    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4307  transposase Tn3 family protein  44.27 
 
 
995 aa  866    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4363  transposase Tn3 family protein  44.87 
 
 
995 aa  872    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457124  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02944  Tn5044 transposase  50 
 
 
990 aa  984    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0926862  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5358  transposase Tn3 family protein  36.65 
 
 
990 aa  675    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17398 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0079  transposase Tn3 family protein  43.38 
 
 
1006 aa  780    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4333  transposase Tn3 family protein  35.75 
 
 
999 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0519662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1731  transposase Tn3 family protein  35.75 
 
 
999 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.473502  normal  0.357058 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5050  transposase Tn3 family protein  35.75 
 
 
999 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4443  transposase Tn3 family protein  35.75 
 
 
999 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.597289  normal  0.3426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2964  Tn4652, transposase  35.56 
 
 
1004 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0744329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2107  transposase Tn3 family protein  35.42 
 
 
1007 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2394  transposase Tn3 family protein  35.42 
 
 
1007 aa  597  1e-169  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2106  transposase  35.12 
 
 
1059 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.818957  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35740  putative transposase  35.69 
 
 
1004 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000831562  decreased coverage  4.65352e-19 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3065  transposase  35.69 
 
 
1004 aa  592  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4134  transposase Tn3 family protein  34.85 
 
 
1028 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160281  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1842  transposase Tn3 family protein  34.19 
 
 
1012 aa  560  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.550818  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2486  transposase Tn3  32.63 
 
 
1013 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147103  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0016  ISSod9, transposase  28.15 
 
 
988 aa  311  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0167  ISSod9, transposase  28.15 
 
 
988 aa  311  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6380  Tn5044 transposase  63.83 
 
 
254 aa  298  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1495  transposase Tn3  27.38 
 
 
988 aa  299  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.487839 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2345  transposase Tn3 family protein  27.69 
 
 
988 aa  298  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4318  transposase Tn3 family protein  28.08 
 
 
964 aa  297  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0052  Tn3 family transposase  28.11 
 
 
988 aa  296  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6179  TnpA transposase Tn4380 mercury transposon Tn3 family  26.87 
 
 
988 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.646837  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0124  Tn3 family transposase  26.87 
 
 
988 aa  296  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.906843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4474  transposase Tn6050  26.87 
 
 
988 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.199867  decreased coverage  0.00670356 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4598  transposase Tn6050  26.87 
 
 
988 aa  296  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210751  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6188  transposase Tn3  28.28 
 
 
989 aa  293  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.480567  hitchhiker  0.0000297094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1205  transposase Tn3 family protein  27.49 
 
 
988 aa  293  8e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5432  transposase Tn3 family protein  27.61 
 
 
985 aa  293  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.478575  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0010  Tn3 family transposase  27.94 
 
 
989 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2145  transposase Tn3 family protein  27.75 
 
 
988 aa  290  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1257  transposase Tn3 family protein  27.21 
 
 
990 aa  284  4.0000000000000003e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3828  transposase Tn3 family protein  27.04 
 
 
990 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3845  transposase Tn3 family protein  27.04 
 
 
990 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1913  transposase Tn3 family protein  27.04 
 
 
990 aa  284  6.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1704  transposase Tn3  25.18 
 
 
1006 aa  283  9e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.019193  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2679  transposase Tn3 family protein  27.04 
 
 
990 aa  283  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.669766  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0036  Tn3 family transposase  26.7 
 
 
990 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.296904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0141  transposon Tn21 transposase TnpA  26.7 
 
 
990 aa  281  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4458  transposase Tn3 family protein  26.49 
 
 
988 aa  277  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.386666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4289  transposase Tn3 family protein  26.49 
 
 
988 aa  277  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4189  transposase Tn3 family protein  26.49 
 
 
988 aa  277  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.346248  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5790  transposase Tn3 family protein  26.81 
 
 
1015 aa  277  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5337  transposase  27.39 
 
 
988 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3983  transposase Tn3 family protein  27.09 
 
 
988 aa  273  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.948733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0630  transposase Tn3 family protein  27.09 
 
 
988 aa  273  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2321  transposase Tn3 family protein  27.14 
 
 
988 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.801463  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3695  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 
969 aa  261  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2998  transposase Tn3  27.11 
 
 
755 aa  257  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0069  transposase  23.38 
 
 
983 aa  257  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197495  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0147  transposase  23.82 
 
 
987 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.857028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0111  transposase  24.97 
 
 
997 aa  247  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  23.65 
 
 
974 aa  244  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4224  transposase Tn3 family protein  24.94 
 
 
994 aa  243  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.398551  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3568  transposase Tn3 family protein  25.71 
 
 
996 aa  242  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0030  transposase  30.95 
 
 
606 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000301486  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4684  transposase Tn3 family protein  25.57 
 
 
988 aa  241  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238188  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0154  transposase x  22.49 
 
 
992 aa  237  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5067  transposase Tn3 family protein  24.47 
 
 
969 aa  237  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0388929  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2183  transposase Tn3 family protein  25.15 
 
 
862 aa  237  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2174  transposase Tn3 family protein  25.15 
 
 
994 aa  237  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00240  transposase  64.71 
 
 
212 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4420  transposase Tn3 family protein  25.15 
 
 
994 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00420695  normal  0.0856947 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0034  transposase, N-terminal region  28.04 
 
 
536 aa  234  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.521113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1105  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 
996 aa  234  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3605  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 
996 aa  234  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3496  transposase Tn3 family protein  25.29 
 
 
996 aa  234  9e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0968755  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3567  transposase Tn3 family protein  25.69 
 
 
877 aa  228  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0660182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2112  transposase Tn3 family protein  23.76 
 
 
988 aa  226  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3666  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
924 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.376312  normal  0.0687479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4378  transposase Tn3  25.92 
 
 
991 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4554  transposase Tn3  25.92 
 
 
991 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3609  transposase Tn3 family protein  25.5 
 
 
976 aa  224  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0836864  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3661  transposase Tn3 family protein  24.62 
 
 
950 aa  221  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4794  transposase Tn3 family protein  24.94 
 
 
991 aa  220  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5458  hypothetical protein  25.56 
 
 
992 aa  220  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5425  transposase Tn3 family protein  25.56 
 
 
992 aa  220  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0088  transposase  26.9 
 
 
771 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.560561 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4776  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 
988 aa  217  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4669  transposase Tn3 family protein  25.42 
 
 
988 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2705  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 
991 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347757  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2941  transposase Tn3 family protein  23.95 
 
 
991 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.360292  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4894  transposase Tn3 family protein  24.7 
 
 
999 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2082  transposase Tn3 family protein  27.57 
 
 
550 aa  212  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.981814  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5092  transposase Tn3 family protein  24.53 
 
 
983 aa  211  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5125  transposase Tn3 family protein  23.82 
 
 
874 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2667  transposase Tn3  26.16 
 
 
961 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.277321  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19600  transposase, TnpA family  25.61 
 
 
1028 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.546457  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0196  transposase  30.49 
 
 
338 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2367  transposase Tn3  25.7 
 
 
815 aa  189  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0346  transposase Tn3 family protein  26.94 
 
 
968 aa  188  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>